NAT MED:肺肿瘤微环境中的基质细胞表型
2018-07-11 海北 MedSci原创
最近,来自比利时的研究人员以单细胞分辨率呈现人肺肿瘤中TME转录组的52,698个细胞目录,并在40,250个额外细胞测序的独立样本中得到了验证。
癌细胞嵌入肿瘤微环境(TME),这是一种复杂的基质细胞生态系统。最近,来自比利时的研究人员以单细胞分辨率呈现人肺肿瘤中TME转录组的52,698个细胞目录,并在40,250个额外细胞测序的独立样本中得到了验证。
通过与匹配的非恶性肺部样本进行比较,研究人员揭示了一种高度复杂的TME,它可以深刻地塑造基质细胞。研究人员鉴定了52种基质细胞亚型,包括迄今被认为是同质的细胞类型中的新亚群,以及其异质性的转录因子。例如,研究人员发现表达不同胶原蛋白组的成纤维细胞,下调免疫细胞归巢以及已建立的免疫检查点转录物和与T细胞活性相关的基因的内皮细胞。
通过在来自1,572名患者的大量RNA测序数据中评估这些细胞亚型的标记基因,研究人员说明了这些基因与生存相关,而选择标记的免疫组织化学将它们验证为独立肺癌系列中的独立细胞实体。
因此,该资源在提供基质细胞类型的综合目录并通过表征其表型和共同行为的同时,提供了对肺癌生物学的更深入的见解,这将有助于推进肺癌诊断和治疗。
原始出处:
Lambrechts D et al. Phenotype molding of stromal cells in the lung tumor microenvironment. NATURE MEDICINE 2018; DOI: 10.1038/s41591-018-0096-5
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