Nature:癌症基因组“暗物质”中发现新的癌症驱动突变

2019-10-20 海北 MedSci原创

最近,研究人员报道,约50%的Shh髓母细胞瘤(Shh-MB)中存在U1剪接小核RNA(snRNA)的高度复发性热点突变。

已有的研究显示,癌症中的复发性体细胞单核苷酸变异(SNV)很大程度上局限于蛋白质编码基因,并且这在大多数儿科癌症中很少见。

最近,研究人员报道,约50%的Shh髓母细胞瘤(Shh-MB)中存在U1剪接小核RNA(snRNA)的高度复发性热点突变。此外,该突变在其他髓母细胞瘤亚组中均不存在。

这种U1-snRNA热点突变(r.3a> g)在其他36种肿瘤类型的2,442种癌症中占<0.1%。婴儿Shh-MB基本上不存在这种突变,这种突变发生在97%的成年人(Shhδ)和25%的青少年(Shhα)患者中。

U1-snRNA突变发生在5'剪接位点结合区域,因此,snRNA突变型肿瘤存在显着被破坏的RNA剪接,并带有过量的5'隐式剪接事件。

突变的U1-snRNA介导的可变剪接使肿瘤抑制基因(PTCH1)失活,并激活癌基因(GLI2,CCND2),是潜在的治疗新靶点,并构成了癌症中非蛋白质编码基因的高度复发性和组织特异性突变。


原始出处:

Hiromichi Suzuki et al. Recurrent non-coding U1-snRNA mutations drive cryptic splicing in Shh medulloblastomaNature, 2019; DOI: 10.1038/s41586-019-1650-0


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