Oncotarget：DNA损伤检查点G2/M在肝癌早期发生起重要作用
2017-07-28 Emma MedSci原创
我国是原发性肝癌（HCC） 发病患者最多的国家，在肿瘤相关死亡中仅次于肺癌，位居第二。由于它早期症状不明显，癌细胞又增殖很快，所以肿瘤发展极为迅速，往往确诊时已届中晚期，死亡率很高。
我国是原发性肝癌（HCC）发病患者最多的国家，在肿瘤相关死亡中仅次于肺癌，位居第二。由于它早期症状不明显，癌细胞又增殖很快，所以肿瘤发展极为迅速，往往确诊时已届中晚期，死亡率很高。研究提示，癌细胞中多个基因发生了突变成为癌基因，检查这些癌基因的表达状态或活化程度，如利用基因芯片进行筛查，能够协助癌症的诊断，若能抑制这些癌基因的表达，则能够对癌症的发生和发展起到控制作用。
发表于Oncotarget的一篇文章中，研究人员分析研究了HCC 的早期分子机制。研究人员从GEO下载了基因表达数据集GSE6764，采用RMA算法对原始文件进行预处理，然后使用基于R语言的SAM方法筛选出797个差异表达基因（DEGs）。采用IPA进行标准路径分析，计算最显著变化的途径，预测上游调控因子。之后为了对分析结果进行验证，又从基因集水平进行基因集富集分析（GSEA）以及前沿分析，以找出多个基因集中出现最多的基因。使用GeneMANIA构建PPI网，使用基于Cytoscape 3.4.0的cytohubba插件计算关键基因。
研究表明，细胞周期中DNA损伤检查点的调节是HCC早期发生的主要途径。通过使用Kaplan-Meier生存分析发现，包括CCNB1、CDC25B、XPO1、GMPS、KPNA2和MELK在内的几种基因的高表达与HCC患者的高风险，预后差和总生存期短相关。G2/M检查点在早期HCC中起重要作用，参与该过程的基因具有作为诊断和预后生物标志物的潜力，有待进一步研究。
原始出处：
Yin L, et al. G2/M checkpoint plays a vital role at the early stage of HCC by analysis of key pathways and genes. Oncotarget. 2017 Jul 18.
doi: 10.18632/oncotarget.19351.
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