利用PubReMiner汇总分析PubMed查询结果提高查询效率
2015-11-03 科研动力 科研动力
利用PubReMiner汇总分析PubMed查询结果提高查询效率，可以对PubMed查询结果进行汇总分析，不仅可以明显的提高PubMed查询效率，而且还可以掌握最新的研究动态。 PubReMiner 是 PubMed 资料分析工具，可以对 PubMed 查询结果进行汇总分析，并且按照不同有的显示方式显示出来。从而对 PubMed&nbs
利用PubReMiner汇总分析PubMed查询结果提高查询效率，可以对PubMed查询结果进行汇总分析，不仅可以明显的提高PubMed查询效率，而且还可以掌握最新的研究动态。
PubReMiner 是 PubMed 资料分析工具，可以对 PubMed 查询结果进行汇总分析，并且按照不同有的显示方式显示出来。从而对 PubMed 的查询结果有个总体把握和认识。PubReMiner 可以统计的项目有出版年份、期刊、作者、国家、MeSH等等很多内容。
这方面的工具也有其它优秀应用，如Web of Knowledge，可是它却是收费的。相反，PubReMiner 却是免费的！如此优秀的应用怎能不介绍给大家。废话少说，来看看如何使用。
PubReMiner的使用方法
首先要进入http://hgserver2.amc.nl/cgi-bin/miner/miner2.cgi，界面如下。
在「Start remining PubMed for」输入 PubMed 检索式。PubMed 检索式如何编写？可以利用 PubMed 高级搜索功能编写。当然，如果您是检索大牛的话，对于 PubMed 检索式了然于胸，也可以直接编写。反正我不会，记不住那么多规则，我只会「Advanced Search」。
我以曾经检索过的一个检索式来说明一下。
把输入PubMed 检索式「(((HIV[MeSH Terms]) AND tuberculosis[MeSH Terms])) OR ((tuberculosis[MeSH Terms]) AND AIDS[MeSH Terms])」输入到「Start remining PubMed for」，其它默认即可。
然后「Start PubReMiner」，会得到一个界面。
在新界面中「Search with Manual Adjustment」
命中2821篇文献，可是默认显示的是1000篇。把「Abstract Limit」调成10000篇。
如果想显示快些，可以把右侧的「columns to display」不显示「mesh」「substance」和「word」。
之后会得到如下结果
PubReMiner 已经把所有文献按照发表年代，杂志，作者等分类了。
从这个结果中我们可以看到，发表此类文章最多是的Lancet，此类研究最多的大牛。当然第一个作者「ET AL」不是作者。
点击右侧的「P」，可以回到 PubMed 看到有关此项的研究。找个大牛看看。我们以第二位作者「CHAISSON RE」为例，点击右侧的「P」，可以看到CHAISSON RE所有的发表文献。这位大牛居然发表了318篇！牛人啊就是牛人。
在Google里搜索一下这位牛人
找到其主页
原来是Johns Hopkins University的一位教授，上面还有他的经历和发表文献。如果您想继续此方面的研究，可以考虑申请他的博士。
有的教授还有FaceBook主页，同样可以找，甚至E-Mail了，Tel了的，都可以找到，联系他吧。
PubReMiner重新搜索
点击需要添加的内容，在左侧选中，如我们只想看发表于 Lancet 和N Engl J Med的文章，选中之后再「Search Again」，会把只发表于Lancet 和N Engl J Med的文章筛选出来，通过上方的「Goto PubMed with query」，又可以回到 PubMed 看到这些结果的具体情况。
另外，还可以把汇总分析的结果导出为TXT文档，再通过Excel分析。
PubReMiner的价值
面对当今信息过剩的年代，PubMed 上的资料也越来越多，我们无法知道哪些东西是有意义的。当然我们可以利用一些工具筛查一下文献，如：
但是PubReMiner 的价值还不在于此，PubReMiner不仅过滤信息，把最好结果呈递给我们，而且还有许多更好的应用。我稍微总结了一下。
1、筛查 PubMed 信息。
2、提供研究趋势，可以根据发表年代的文献数量，看出这方面的研究是增加还是在减少。因此利用这个，可以初步考虑一下进行此方面的研究是否有价值。
3、提供投稿方向。根据相应发表此类文献的杂志，可以初步考虑一下向何种杂志投。当然发表此类文献最多的杂志是首选，因为编辑们对此方面感兴趣。如果一个杂志此类研究尚未发表一个，决定投此杂志之前要考虑一下了。
4、提供了世界上谁在做此类研究。根据作者信息，可以看到此类研究最多的大牛是谁。如果想外出深造，当然首选此类大牛。出研究成果的机率也就大大的增加。通过Google完全可以找到此位大牛在哪，有啥联系方式。唉，现今社会，人还有隐私吗？！
5、相比于Web of Knowledge免费，这点很重要。
本网站所有内容来源注明为“梅斯医学”或“MedSci原创”的文字、图片和音视频资料，版权均属于梅斯医学所有。非经授权，任何媒体、网站或个人不得转载，授权转载时须注明来源为“梅斯医学”。其它来源的文章系转载文章，或“梅斯号”自媒体发布的文章，仅系出于传递更多信息之目的，本站仅负责审核内容合规，其内容不代表本站立场，本站不负责内容的准确性和版权。如果存在侵权、或不希望被转载的媒体或个人可与我们联系，我们将立即进行删除处理。
在此留言
#REM#
28
#汇总分析#
45
不错！
147
收藏了
120
收藏了
81
与gopubmed有多大区别
135
十分有用，谢谢楼主
147
有用
95
收藏
54
先收藏慢慢看
54