Nat Genet：两篇文章发现亚洲人特异的心房颤动基因突变
2017-04-21 王迪 测序中国
心房颤动是一种心律失常，估计影响全球 3300 万人群。之前已发现了十多个变异与欧洲人的心房颤动风险相关，1 个变异与亚洲人的心房颤动风险相关。在 4 月 18 日发表在《Nature Genetics》上的两项独立研究中，研究人员通过荟萃分析和全基因组关联研究发现了其他心房颤动风险变异，使这种变异的总数达二十多个。另外，这两项研究均表明 SH3PXD2A 附近的变异影响亚洲人的心房颤动风险，SH
在 4 月 18 日发表在《Nature Genetics》上的两项独立研究中，研究人员通过荟萃分析和全基因组关联研究发现了其他心房颤动风险变异，使这种变异的总数达二十多个。另外，这两项研究均表明 SH3PXD2A 附近的变异影响亚洲人的心房颤动风险，SH3PXD2A 编码 invadosome 相关的支架蛋白，SH3PXD2A 在人类心房和心室中表达，对神经鞘迁移很重要。
在第一篇论文中，Broad 研究所 Patrick Ellin 领导的心房颤动遗传学（AFGen）联盟对全基因组关联研究、全外显子关联研究和罕见变异关联研究进行了荟萃分析，包括大约 22，300 例心房颤动患者和 132，000 例对照。在使用 BioBank Japan 研究和 UK Biobank 的病例和对照进行复制研究后，AFGen 联盟确定了 12 个新的与心房颤动风险相关的基因位点。
研究人员指出，现在有 7 个心房颤动相关的基因位点与心电图特征、左心室内舒张期直径和中风等表型相关。此外，这些风险基因位点附近的许多基因编码钾或钠通道。他们还发现了一个与 SH3PXD2A 相关的变异，是亚洲人所特有的。
在另一篇文章中，Riken 综合医学中心的 Toshihiro Tanaka 进行了一项 GWAS 分析，利用 8，180 例心房颤动病例和 28，612 例对照寻找日本人的心房颤动风险变异。在进一步分析了 3，120 例病例和 125，000 例对照后，他们找到了 6 个新的心房颤动风险相关的基因位点，位于 KCND3、PPFIA4、SLC1A4–CEP68、HAND2、NEBL 和 SH3PXD2A 附近。
他们又使用 AFGen 联盟的 GWAS 荟萃分析数据（包括 16，000 例病例和 113，700 例对照）进行计算机复制研究，发现最显着关联的基因位点是 SLC1A4-CEP6，而其他 SNP 仅为名义上关联。这表明两个研究队列间存在异质性。
总的来说，Tanaka 等人发现，在他们的日本人队列中与心房颤动最显着相关的位点是 HAND2 基因，HAND2 编码心脏形态学相关的蛋白。该变异的次要等位基因在东亚人中更常见。
Tanaka 等人在论文中写道，“由于不同人群的复杂连锁不平衡结构和不同的环境暴露，确定特定人群的心房颤动风险因素非常必要，因为这些可以用于更好地预测不同地区心房颤动的风险。”
原始出处：
1. Low SK， Takahashi A， Ebana Y， et al. Identification of six new genetic loci associated with atrial fibrillation in the Japanese population. Nat Genet. 2017 Apr 17.
2. Ingrid E Christophersen，Michiel Rienstra，Carolina Roselli，et al. Large-scale analyses of common and rare variants identify 12 new loci associated with atrial fibrillation. Nat Genet. 2017 Apr 17.
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