基因芯片公开数据获取、分析
2019-02-21 tommyhechina CSDN
基因芯片公开数据很多,主要包括GEO,ArrayExpress等,现进行简要介绍。Gene Expression Omnibus database (GEO)是由NCBI负责维护的一个数据库,设计初衷是为了收集整理各种表达芯片数据,但是后来也加入了甲基化芯片,甚至高通量测序数据!用GEOquery从GEO数据库下载数据。GEO数据库基础知识GEO Platform (GPL) 芯片平台GEO Sa
GEO Platform (GPL) 芯片平台
GEO Sample (GSM) 样本ID号
GEO Series (GSE) study的ID号
GEO Dataset (GDS) 数据集的ID号 ## 用法
只需要记住三个函数,以及每个函数返回的对象该如何处理即可
getGEO/getGEOfile/getGEOSuppFiles
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#基因芯片#
21
#芯片#
25
学习了,谢谢分享
46
有教程吗?
46
啊
49
认真学习,谢谢分享
44