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J med virol:蛇是最有可能的携带2019-nCoV冠状病毒的野生动物

2020-1-23 作者:不详   来源:网络 我要评论0
Tags: 2019-nCoV病毒  

当前武汉市病毒性肺炎的暴发是由世界卫生组织命名为2019-nCoV的新型冠状病毒引起的,该病毒是通过对病毒RNA基因组测序确定的。在华南海鲜批发市场,许多患者可能接触到野生动物,那里还出售家禽,蛇,蝙蝠和其他野生动物。

2020年1月22日,北京大学,广西中医药大学,宁波大学及武汉生物工程学院学者联合攻关,Journal of Medical Virology 在线发表题为“Homologous recombination within the spike glycoprotein of the newly identified coronavirus may boost cross‐species transmission from snake to human”的研究论文,为了确定可能的病毒库,该研究基于新发现的冠状病毒2019-nCoV的现有序列,结合不同动物物种之间的相对同义密码子使用偏倚(RSCU)情况进行了全面的序列分析和比较。分析中获得的结果表明,2019-nCoV似乎是蝙蝠冠状病毒与起源未知的冠状病毒之间的重组病毒。重组发生在病毒spike糖蛋白内,该蛋白识别细胞表面受体。此外,该研究结果表明,与其他动物相比,基于蛇的RSCU偏差类似,蛇是最有可能的携带2019-nCoV病毒的野生动物。

综上所述,该结果表明,spike糖蛋白内的同源重组可能有助于从蛇到人的跨物种传播。



在过去的20年中,中国目睹了几种新出现的病毒性疾病,包括1997年的禽流感,2003年的严重急性呼吸道综合症(SARS)和2013年的严重血小板减少症候群(SFTS)。最近的危机是在中国武汉市发生的病因不明的病毒性肺炎的爆发。2019年12月12日,武汉市卫生委员会(WMHC)报告了27例病毒性肺炎病例,其中7例危重病。他们都有与华南海鲜批发市场有关的接触历史,那里也出售家禽,蝙蝠和蛇。

2020年1月3日,武汉市卫生委员会(WMHC)将案件总数更新为44起,其中11起处于危急状态。1月5日,病例数增加到59例,其中7例重症患者。根据实验室测试,病毒性肺炎的爆发不是由严重的急性呼吸综合征冠状病毒(SARS-CoV),中东呼吸综合征冠状病毒(MERS-CoV),流感病毒或腺病毒引起的。 1月10日,据报道,通过对病毒RNA基因组进行测序,鉴定了一种由世界卫生组织(WHO)命名为2019-nCoV的新型冠状病毒。更重要的是,还从一名患者中分离出了新发现的病毒。

病毒RNA序列的确定使开发逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)方法成为可能,该方法可用于检测患者和潜在宿主样品中的病毒RNA。结果,截至2020年1月20日,确认有217名患者感染了新发现的冠状病毒2019-nCoV,三名患者死亡。共有14种新型冠状病毒的全长序列被释放到GISAID。

冠状病毒科根据其遗传特性由四个属组成,包括Alphacoronavirus属,Betacoronavirus属,Gammacoronavirus属和Deltacoronavirus属。在所有RNA病毒中,冠状病毒RNA基因组(范围从26到32 kb)最大。冠状病毒可以感染哺乳动物,鸟类和爬行动物,包括人,猪,牛,马,骆驼,猫,狗,啮齿动物,鸟类,蝙蝠,兔子,雪貂,貂,蛇和各种野生生物。许多冠状病毒感染是亚临床的。严重急性呼吸系统综合症冠状病毒(SARS-CoV)和中东呼吸系统综合症冠状病毒(MERS-CoV)属于Beta冠状病毒属,是可引起人类严重呼吸系统疾病的人畜共患病原体。

武汉市爆发的病毒性肺炎与华南海鲜批发市场的暴露有关,表明可能存在人畜共患病。海鲜市场还出售蛇,土拨鼠,蝙蝠,鸟类,青蛙,刺猬和兔子等活体动物。没有证据表明特定的野生动植物宿主可以作为病毒库。病毒与其宿主之间的相对同义密码子使用偏倚(RSCU)偏向的研究表明,病毒趋向于发展与其宿主相类似的密码子偏倚。

为了寻找潜在的病毒库,研究人员进行了全面的序列分析和比较。研究分析结果表明,蛇是造成当前2019-nCoV感染爆发的最可能的野生动植物库。更有趣的是,在2019-nCoV的spike糖蛋白中发现了未知来源的同源重组,这可能解释了蛇对人跨物种传播以及有限的人际传播。


原始出处:

Wei Ji  Wei Wang  Xiaofang Zhao  Junjie Zai  Xingguang Li. Homologous recombination within the spike glycoprotein of the newly identified coronavirus may boost cross‐species transmission from snake to human. J med virol https://doi.org/10.1002/jmv.25682



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