CLIN CHEM：通过新型DNA环状连接测定（LOLA）检测血液恶性肿瘤中的染色体易位

近日，国际杂志 《Clinical Chemistry》上在线发表一项关于通过通过新型DNA环状连接测定（LOLA）检测血液恶性肿瘤中的染色体易位的研究。

疾病相关染色体易位在各种肿瘤中非常常见，特别是淋巴瘤和白血病中。由于分布在大片的区域上的染色体断裂点，因此在DNA水平上的易位检测通常较为复杂。研究人员已经开发了基于连接的测定法[循环连接测定（LOLA）]来检测具有多个广泛间隔的断点热点的疾病易位。

研究人员设计了寡核苷酸组探针检测淋巴细胞淋巴瘤（FL）中的IGH-BCL2（免疫球蛋白重链凋亡调节因子），Burkitt淋巴瘤（BL）MYC-IGH（MYC原癌基因，bHLH转录因子-免疫球蛋白重）和慢性粒细胞白血病（CML）中的BCR-ABL1（RhoGEF和GTPase激活蛋白-ABL原癌基因1，非受体酪氨酸激酶）的断点。将来自具有这些易位细胞系的DNA与寡核苷酸在单步连接反应中混合，随后进行PCR扩增，通过毛细管电泳检测。研究人员还测试了16例CML患者的外周血和17例FL病例的冷冻组织，结果使用逆转录(RT)pcr(CML)或荧光原位杂交(FISH)和δ-PCR(FL)进行比较。

研究发现，LOLA产生了与细胞系预期大小的信号，而正常对照DNA不产生信号。稀释样品系列在低至1％的稀释度下产生易位特异性峰。信号强度与DNA浓度成线性关系（R2=0.94）。此外，研究人员能够从53.3％的FL患者和87.5％的CML患者中检测到DNA中的LOLA峰。FL中的LOLA，FISH和δ-PCR之间的一致性也很好。

研究结果表明，LOLA是一种简单的方法，可用于在具有挑战性的情况下基于DNA的易位检测，特别是在断点不紧密聚集的情况下。该测定方法还具能够对快速映射断点进行检测。

原始出处：

Shuko Harada, Emily Sizzle, Ming-Tseh Lin,et al. Detection of Chromosomal Translocation in Hematologic Malignancies by a Novel DNA-Based Looped Ligation Assay (LOLA)

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