RNA-seq技术揭示与前列腺癌有关的新型融合基因
2012-03-21 MedSci MedSci原创
前列腺癌发病率在西方国家位于男性恶性肿瘤首位，而随着我国普遍医疗水平的提高，以及我国社会人口老龄化，该病发病率近年来显著上升。前列腺癌有着明显的种族特异性，然而，产生这种特异性的分子生物学机制至今未明。 973首席科学家第二军医大学上海长海医院孙颖浩教授运用RNA-seq技术首次对中国人前列腺癌及癌旁组织进行系统研究，发现新型融合基因、癌相关长链非编码RNA、异构体和点突变。研究
前列腺癌发病率在西方国家位于男性恶性肿瘤首位，而随着我国普遍医疗水平的提高，以及我国社会人口老龄化，该病发病率近年来显著上升。前列腺癌有着明显的种族特异性，然而，产生这种特异性的分子生物学机制至今未明。
973首席科学家第二军医大学上海长海医院孙颖浩教授运用RNA-seq技术首次对中国人前列腺癌及癌旁组织进行系统研究，发现新型融合基因、癌相关长链非编码RNA、异构体和点突变。研究发现，在欧美人群中普遍高频表达（50-80%）的融合基因TMPRSS2-ERG在中国人群中的表达率仅有20%左右，而在欧美人群中尚未发现的融合基因CTAGE5-KHDRBS3和USP9Y- TTTY15在中国人群中却有很高的表达频率，分别为37%和35.2%，提示这些融合基因具有中国人群特异性。
研究人员发现多个癌组织差异性表达的长链非编码RNA进行了验证，发现PCA3，FR0348383 和MALAT-1在癌组织中的过表达率分别为80%，72.5%和82.5%，FR0257520 在癌组织中的低表达率为82.5%。此外，研究者还发现并验证了PSA新型异构体，具有潜在的诊断价值。
研究人员根据此次研究结果绘制了中国人群特异性的前列腺癌图谱，提出了3条关键信号通路，为深入认识中国人群前列腺癌的发生发展机制奠定基础。这些研究成果是第二代测序的成功范例，首次揭示了中国人群前列腺癌的全貌，新研究为进一步了解前列腺癌的诊断、发病演化机制和种族差异性提供了新线索。
据悉，文章第一作者上海长海医院泌尿外科主治医师任善成博士近期也获得美国前列腺癌基金会（Prostate Cancer Foundation，PCF）青年学者奖（Young Investigator Award），其研究项目《中国人群特异的融合基因在前列腺癌发病机制及临床应用中的研究》获得基金会3年的资助，从而成为基金会19年历史上第一位获此殊荣的中国学者。相关论文发表在2月21日的《细胞研究》（Cell Research）期刊上。
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