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Nature:新的冠状病毒筛查方法应用于近期的SARS-CoV-2暴发

2020-2-25 作者:Nature自然科研   来源:Nature自然科研 我要评论0
Tags: 冠状病毒    筛查方法  

《自然-微生物学》发表的一篇论文Functional assessment of cell entry and receptor usage for SARS-CoV-2 and other lineage B betacoronaviruses报道了一种快速筛查SARS样冠状病毒的方法,检测病毒感染不同物种细胞的能力。研究人员用中国出现的新型冠状病毒测试了这种方法,已知这种新型冠状病毒与其他SARS相关冠状病毒使用相同的人类受体。

作为冠状病毒的一个属,β冠状病毒(β-CoV)又可分为四个谱系。其中,B谱系包含SARS-CoV和最新的SARS-CoV-2,已有超过200个病毒序列发表。随着基因测序的发展,全球动物种群体内的数千个新病毒序列相继揭晓。不过,尚不知这些病毒是否会出现在人体内,而目前检测它们是否可以进入人类细胞的技术都存在技术门槛高、耗时、费用高的问题。

所有冠状病毒都会编码一种表面蛋白,也称棘突,这个蛋白会与一个细胞受体相结合,介导病毒进入细胞。对于β冠状病毒来说,棘突蛋白的一个区域,即受体结合域(RBD),会与宿主细胞发生相互作用。一旦结合,附近的一个蛋白酶家族的宿主酶会剪切棘突,帮助病毒进入。美国国立卫生研究院,国立过敏和传染病研究院的Vincent Munster和同事描述了一种新方法,可以快速筛查B谱系β冠状病毒的受体结合域,比传统方法更快,成本效率比更高。作者用这种方法检测了B谱系β冠状病毒所有已发表的受体结合域序列的受体使用情况。他们发现,这些受体结合域可以分为三个不同分支,利用血管紧张素转换酶2(ACE2)这种人体细胞受体进入细胞的属于分支1。

在这项研究开展的过程中,中国暴发了一种新型冠状病毒。作者利用这种新的筛查技术,快速确认了ACE2受体就是SARS-CoV-2进入细胞的入口。他们在分析该病毒的棘突时发现,其与分支1中的其它病毒最为相似,包括SARS-CoV。 

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