Nat Microbiol:与炎症性肠病和抑郁症有关的肠型
2019-06-26 佚名 生物通
比利时VIB-KU Leuven微生物学中心教授Jeroen Raes于2012年成立了Flemish Gut Flora计划，旨在确定健康相关肠道微生物群的普遍界限，对3000多名健康志愿者的粪便样本进行了测序。最近，他们在《Nature Microbiology》发表文章，描述了缺乏某些抗炎细菌的B2肠型在多诊断中的高患病率研究。
比利时VIB-KU Leuven微生物学中心教授Jeroen Raes于2012年成立了Flemish Gut Flora计划，旨在确定健康相关肠道微生物群的普遍界限，对3000多名健康志愿者的粪便样本进行了测序。最近，他们在《Nature Microbiology》发表文章，描述了缺乏某些抗炎细菌的B2肠型在多诊断中的高患病率研究。
比较微生物组
炎症性肠病（IBD）是以肠道慢性炎症为特征的几种疾病，包括溃疡性结肠炎和克罗恩病。原发性硬化性胆管炎（PSC）是一种慢性肝病，伴有胆管炎症和结疤，也常伴有IBD。在新研究中，VIB-KU-Leuven的科学家描述了IBD和PSC患者的微生物组分。
Jeroen Raes教授说：“多年来，世界各地的许多研究小组都试图描述与疾病相关的微生物群变化。尤其是IBD更是微生物学研究的热点。我们的研究在三个方面不同于以往。首先，我们比较了来自Flemish Gut Flora计划目录中超过3000名健康志愿者的微生物群。第二，在我们的分析中，我们不仅观察了粪便样本中不同细菌的百分比，还使用了一种新技术来量化它们的丰度。第三，我们修正了我们的研究结果中的一些因素，如松散的粪便等等这些因素在所研究的疾病中都很常见，但实际上它们会影响微生物组分析的结果。”
疾病的微生物指纹
结合科学家在定量微生物群分析方面的独特专业知识和他们对健康相关微生物群变异的知识，科学家们发现了一种变异的微生物群结构——也被称为肠型——在患者群中具有很高的患病率。虽然13%的健康志愿者中也观察到了这种肠型，但PSC和IBD患者的患病率更高，在38%到78%之间。
参与这项研究胃肠病学家Séverine Vermeire教授解释说：“这种我们称之为B2肠型的异常微生物群结构具有低细菌丰度和生物多样性的特点。它的抗炎细菌，如粪杆菌，明显不足。事实上，我们发现B2型肠炎患者的肠道炎症水平较高。即使在健康人中，这种肠道类型的携带者的总体低级炎症水平也稍高。”
肠道炎症、微生物和抑郁症
令人惊讶的是，就在几个月前，Raes教授的实验室描述了一种类似的微生物群变化，这种变化与较低的生活质量甚至抑郁有关。
Jeroen Raes教授说：“在不同的患者群体中观察到的微生物群落变化似乎有很大的重叠。我们在大约26%的抑郁症患者中检测到了B2型肠型。虽然肠道微生物群已被证明在溃疡性结肠炎和克罗恩病等疾病的发展中发挥作用，但对于抑郁症来说，这一点还不太清楚。然而，我们将在未来的研究中更详细地探讨B2肠型和抑郁症之间的关系。”
虽然大约13%的健康人也是B2肠型的携带者，但研究人员强调这不足以过分关注。
Jeroen Raes教授：“在这一点上，我们不能根据一个人的肠道类型对疾病易感性或风险做出任何预测。此外，肠道类型不是固定的，可以通过改变饮食来改变。所观察到的疾病与微生物群之间的联系并不意味着肠道细菌确实导致了疾病。许多个人、生活方式和环境因素与B2肠型有关。然而，由于在某些个体中，炎症也是B2的相关因素，我们肯定会进一步研究潜在的因果关系。”
原始出处：Vieira-Silva S1,2, Sabino J3, Valles-Colomer M1, et al. Quantitative microbiome profiling disentangles inflammation- and bile duct obstruction-associated microbiota alterations across PSC/IBD diagnoses. Nat Microbiol. 2019 Jun 17.
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