Blood:发现一个对颗粒细胞分化至关重要的增强子!

2019-04-12 MedSci MedSci原创

中心点:小鼠Cebpe的表达受位于其TSS下游6kb的增强子调控。敲除小鼠Cebpe TSS下游6kb的增强子可完全阻滞粒细胞分化。摘要:CCAAT/增强子结合蛋白epsilon(CEBPE)是粒细胞分化的一个重要的转录因子。CEBPE突变常见于中性粒细胞特异性颗粒缺陷(SGD)的个体,SGD的特征是中性粒细胞成熟障碍。Cebpe敲除小鼠也表现为颗粒细胞终末分化障碍,可再现SGD患者的表型。DNa

中心点:

小鼠Cebpe的表达受位于其TSS下游6kb的增强子调控。

敲除小鼠Cebpe TSS下游6kb的增强子可完全阻滞粒细胞分化。

摘要:

CCAAT/增强子结合蛋白epsilon(CEBPE)是粒细胞分化的一个重要的转录因子。CEBPE突变常见于中性粒细胞特异性颗粒缺陷(SGD)的个体,SGD的特征是中性粒细胞成熟障碍。

Cebpe敲除小鼠也表现为颗粒细胞终末分化障碍,可再现SGD患者的表型。DNase测序数据表明,在小鼠髓系细胞中,Cebpe转录起始点下游6kb的区域为开放行染色质。研究人员通过4C测序发现该+6kb区域与Cebpe的核心启动子存在相互作用。

研究人员推测该+6kb区域可能是一个增强子,为揭示该增强子在Cebpe转录调控中的作用,研究人员采用dCas9-KRAB靶向该+6kb区域,发现用靶向该+6kb区域的靶向RNA处理过的细胞,CEBPE的转录和蛋白水平均明显降低。

为进一步明确该新发现的增强子在髓系细胞发育中的作用,研究人员建立一敲除该+6kb的小鼠模型。结果显示敲除该+6kb区域后,CEBPE及其靶基因的表达水平均明显降低,导致颗粒细胞分化严重阻滞。

研究人员还发现CEBPA和CEBPE均可与该+6kb增强子结合,提示CEBPA和CEBPE可能参与Cebpe表达的调控。

综上所述,研究人员发现了一个新的增强子,可调控Cebpe的表达,对颗粒细胞正常分化至关重要。

原始出处:

Pavithra Shyamsunder, et al.Identification of a novel enhancer of CEBPE essential for granulocytic differentiation.Blood 2019 :blood.2018886077; doi: https://doi.org/10.1182/blood.2018886077 

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