Blood：乳腺植入相关淋巴瘤的基因突变特征
2019-12-02 QQY MedSci原创
乳腺植入相关的间变性大细胞淋巴瘤(BI-ALCL)的癌变发生机制仍不明确。为了解析其发病机制，研究人员对来源于54位BI-ALCL患者的34例BI-ALCLs（15例肿瘤，19例原位亚型）样本进行基因组图谱进行分析。
中心点：
JAK/STAT通路中表观遗传修饰因子和基因改变的累积或可驱动BI-ALCL肿瘤形成。
对大量BI-ALCL样本进行全外显子测序证实表观调控区存在复发性突变。
摘要：
乳腺植入相关的间变性大细胞淋巴瘤(BI-ALCL)的癌变发生机制仍不明确。为了解析其发病机制，研究人员对来源于54位BI-ALCL患者的34例BI-ALCLs（15例肿瘤，19例原位亚型）样本进行基因组图谱进行分析。
通过全外显子测序（22对肿瘤-胚系DNA）和（或）深度靶向测序（24例）发现在74%的病例的表观修饰区存在复发性突变，包括KMT2C（26%）、KMT2D(9%)、CHD2(15%)和CREBBP(15%)。KMT2D和KMT2C突变与免疫组化H3K4单甲基化和三甲基化缺失相关。
20例病例（59%）至少携带JAK/STAT信号通路上的一个基因突变，包括STAT3（38%）、JAK1（18%）、STAT5B（3%）和负性调控子样SOCS3（6%）、SOCS1(3%)和PTPN1(3%)。这些突变在肿瘤样本中比在原位样本中更常见（p=0.038）。
所有BI-ALCLs均表达pSTAT3，无论JAK/STAT信号通路的基因的突变状态如何。此外，研究人员还检测到了参与淋巴发育的EOMES基因突变（12%）、PI3K-AKT/mTOR突变（6%）和TP53功能丧失性突变（12%）。拷贝数变异（CNA）分析，在染色体2、9p、12q和21上检测到拷贝数扩增，在染色体4q、8p、15、16和20上检测到拷贝数缺失。CNA区域涵盖JAK/STAT信号通路上的基因和表观遗传调控区。
综上所述，本研究表明BI-ALCL遗传谱不仅有JAK/STAT激活突变，还有表观遗传调控区的功能丧失性变异。
原始出处：
Camille Laurent， et al.Gene alterations in epigenetic modifiers and JAK-STAT signaling are frequent in breast implant-associated ALCL.Blood. November 27，2019.
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