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CLIN CHEM:液体活检靶向重测序如何多重消除野生型DNA?

2017-10-17 作者:MedSci   来源:MedSci原创 我要评论3
Tags: 液体活检  
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从液体活组织检查中收集的临床样品和循环的无细胞DNA(cfDNA)在癌症中的诊断和预后的应用正在迅速发展,人们希望一种能够有减少过量野生型(WT)样品部分影响的改良方法。近日,国际杂志 《CLIN CHEM》在线发表一项关于使用WT 的DNA酶降解来对包含突变序列进行突变富集,突变富集与在多重闭管反应中进行的高分辨率熔解(HRM)结合,作为靶向重测序之前的快速有效的筛选工具。

研究人员开发了一种均匀的闭管方法,该方法使用双链DNA特异性核酸酶同时在多个靶标上降解WT DNA。采用探针重叠(ND-NaME-PrO)的无变性核酸酶辅助的次要等位基因富集利用WT寡核苷酸在推定的DNA靶标上将两条链重叠。在部分变性(DNA呼吸)的条件下,寡核苷酸探针在选定的靶标上增强双链DNA特异性核酸酶消化,从而使对WT偏好高于突变体DNA。为了验证ND-NaME-PrO,研究人员使用多重HRM,数字PCR和MiSeq靶向重测序突变基因组DNA和cfDNA。

研究显示含...

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所属期刊:CLIN CHEM 影响因子:8.008 期刊论坛:进入期刊论坛
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tanxingdoctor

学习啦!谢谢分享

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2017-10-18 9:50:51 回复

doctorJiangchao

谢谢分享.

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2017-10-18 7:03:04 回复

有备才能无患

从液体活组织检查中收集的临床样品和循环的无细胞DNA(cfDNA)在癌症中的诊断和预后的应用正在迅速发展.人们希望一种能够有减少过量野生型(WT)样品部分影响的改良方法.

(来自:梅斯医学APP)

2017-10-17 23:04:16 回复

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