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Blood:通过DNA甲基化模式对CLL患者预后分层

2019-7-14 作者:MedSci   来源:MedSci原创 我要评论0
Tags: DNA甲基化  CLL  表位型  

整体DNA甲基化模式的改变是癌症的一个主要特征,也是个性化风险分层的一个有力的生物标志物。慢性淋巴细胞白血病(CLL)风险分层研究通常集中在首次治疗时间(TTFT)、治疗后进展时间(TTP)和总体存活率(OS)。但随着时间的推移,TTFT的风险分层仍然相似,而随着靶向治疗的引入,如Bruton酪氨酸激酶抑制剂依鲁替尼, TTP和OS均发生了明显变化。

近日,Giacopelli等人发现CLL患者全基因组的DNA甲基化模式与表型分化和患者预后高度相关,并开发了一种新的检测,称为甲基化-iPLEXX(Me--iPLEX),可从多个独立位点对单个CpGs靶向板进行高通量定量检测。

Me-iPLEX被用来将CLL样本归类到三种已知的表观遗传学亚型(表位型)之一。研究人员在来自4个独立队列的1286位CLL患者中检测了表位型的影响,发现表位型对新确诊的CLL患者的TTFT和OS有显著的预测作用。

此外,表位型还可预测采用两种常见的CLL疗法(化学免疫疗法[CIT]和依鲁替尼)的TTP和OS。根据生物学相关的生物标志物、IGHV-突变状态、ZAP70表达以及其他常见的预后标志物进行分层后,表位型的显著性增加。研究人员在表位型之间几个富集的生物学特征中发现了高度偏移的免疫遗传特征,包括IGLV3-21在特征不明显的中间态CLL表位型中的使用情况。

总而言之,Me-iPLEX是一种评估表观遗传特征的优雅方法,包括对CLL表位型的稳定分类,该分类方法可独立地对诊断和治疗时的患者风险进行分层。


原始出处:

Brian Giacopelli, et al.Developmental subtypes assessed by DNA methylation-iPLEX forecast the natural history of chronic lymphocytic leukemia. Blood 2019 :blood.2019000490; doi: https://doi.org/10.1182/blood.2019000490

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