J Periodontal Res: ：唾液转录组作为判断疾病易感性的新生标志物的可行性
2018-07-25 MedSci MedSci原创
唾液转录组可能是一种容易获得和非侵入性的潜在生物标志物的来源。慢性牙周炎的发展取决于个体患者的易感性；因此，本研究的目的是确定唾液转录组作为使用慢性牙周炎的疾病易感性的生物标志物的潜力。
唾液转录组可能是一种容易获得和非侵入性的潜在生物标志物的来源。慢性牙周炎的发展取决于个体患者的易感性；因此，本研究的目的是确定唾液转录组作为使用慢性牙周炎的疾病易感性的生物标志物的潜力。
使用Oragene RNA试剂盒，从10名患有慢性牙周炎的患者和10名没有慢性牙周炎的患者的唾液中纯化总RNA。测定总RNA的数量和质量，并使用Affymetrix微阵列系统进行通过cDNA的基因表达测量。通过实时定量聚合酶链反应进一步验证微阵列分析结果。
结果：分光光度分析显示每个患者 的样本中纯化的总RNA量为0.92μg/500μL-62.85μg/500μL。2组中获得的总RNA数量变化很大，牙周炎组平均为10.21±12.71μg/500μL，对照组为15.97±23.47μg/500μL。此外，大多数患者（9个牙周炎和6个对照）的RNA纯度（基于A260 / A280比率）在下游分析的可接受限度内（2.0±0.1）。研究样本在细菌rRNA的23S（3800bp）和16S（1500bp）特征上显示出2个不同的条带。对4个样本（P2，P6，H5和H9）进行初步微阵列分析。 4个样本中每个样本中存在的基因百分比与检测到的基因的约1.8％-18.7％不一致。定量实时聚合酶链反应证实，从每个样本中纯化的总RNA主要是有最小mRNA的细菌RNA（Uni 16S）。
该研究表明，能够从患有牙周炎和对照的患者的唾液中分离出微量人RNA。如果将唾液转录组用于确定个体患者的易感性，还需要进一步的研究来强化唾液中人mRNA的提取过程。
原始出处：
M. F. H. Hidayat， et al. Feasibility of the salivary transcriptome as a novel biomarker in determining disease susceptibility. Journal of Periodontal Research. 2018 June. doi： 10.1111/jre.12522
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