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JCLA:代谢途径相关lncRNA在人类胃癌中的表达谱,以及RP11‐555H23.1作为新的诊断生物标志物的鉴定

2019-7-12 作者:Gladiator   来源:MedSci原创 我要评论0

研究表明,长链非编码RNA (lncRNA)具有调节代谢的作用;然而,代谢途径‐相关lncRNA癌中的表达谱尚不清楚。本研究的目的是研究代谢途径相关lncRNA癌中的作用及其可能的诊断价值。

利用代谢通路相关lncRNA芯片检测胃癌和配对非肿瘤组织中代谢通路相关lncRNA的差异表达模式。RP11555H23.1是一种具有代表性的代谢通路‐相关lncRNA,通过定量实时逆转录‐聚合酶链反应(qRTPCR)验证了其表达。分析RP1155H23.1表达与胃癌患者临床病理特征的关系。进一步建立了接收者工作特性曲线。

在肿瘤组织和非肿瘤组织中共发现114个差异表达的代谢通路‐相关lncRNA(>2的倍数变化,P < 0.05) (GEO NoGSE96856)。其中TUG1RP11555H23.1RP1257I20.13UGP2GCSHP3XLOC_000889 lncRNA在胃癌组织中下调超过6倍。相比之下,胃癌组织中RP11605F14.2TBC1D3P5BC130595LINC00475RP1119P22.6BC080653XLOC_004923AFAP1AS1EPB49RP11296I10.3 lncrna的上调幅度超过6倍。我们进一步证明RP11555H23.1表达与TNM分期显著相关(P = 0.038)ROC曲线下面积(AUC)0.65,特异性和敏感性分别为62%81%

代谢通路相关lncrRNA在胃癌的发生过程中发挥着重要作用,而代谢通路相关lncRNA,如RP11555H23.1,可能是胃癌新的生物标志物。

原始出处:

Xiaoyan Mo, Yuanyuan Wu ,Global expression profiling of metabolic pathwayrelated lncRNAs in human gastric cancer and the identification of RP11555H23.1 as a new diagnostic biomarker

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