Blood：单细胞测序揭示驱动HSC体外生成的转录因子和分子通路
2020-07-14 MedSci原创 MedSci原创
一直以来，造血干细胞体外扩增都是一个难以克服的挑战，Fidanza等通过单细胞测序发现了参与HSC体外生成的转录因子和分子通路，是否有助于解决HSC体外难以有效扩增的困境？
造血干细胞和祖细胞（HSPC）在胚胎发育过程中的不同解剖部位通过不同的波来发育。人多能干细胞（hPSC）的体外分化能够重现其中的部分过程，但是，事实证明很难产生功能性造血干细胞（HSC）。
为了解析hPSC在体外产生HSPC的动力学和异质性，研究人员利用单细胞RNA测序（scRNAseq）与单细胞蛋白质表达分析相结合来进行研究。
生物信息学分析和功能验证确定了幼稚祖细胞和类红细胞，以及巨核细胞和白细胞定型祖细胞的转录组，明确CD44、CD326、ICAM2/CD9和CD18分别是这些祖细胞的标志物。
采用根据人胎儿肝脏的scRNAseq建立的人工神经网络（ANN），研究人员可鉴定出多种hPSCs衍生的HPSC表型，包括一小类被分类为HSCs的表型。
这种瞬时HSC样细胞群随着分化的进展而减少，最后在基于CD43表达筛选的细胞的数据集中完全消失。通过将体外产生的HSC样细胞的单细胞转录组与胎儿肝脏内产生的单细胞转录组进行对比，研究人员确定了将来可用于改善HSC体外生成的转录因子和分子途径。
原始出处：
Antonella Fidanza，et al. Single cell analyses and machine learning define hematopoietic progenitor and HSC-like cells derived from human PSCs. Blood. July 2，2020.
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非常好的研究
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