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Arthritis rheumatology:LC3B,仅仅是自噬标记物那么简单吗?一个与中国人系统性红斑狼疮有关的罕见变异体

2017-10-21 作者:fengxiangxin   来源:MedSci原创 我要评论2
Tags: 系统性红斑狼疮  变异  自噬  
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近期的遗传学、细胞生物学和动物模型研究表明自噬在影响系统性红斑狼疮(SLE)的发生中具有关键作用。然而,尚未有研究对这一理论的遗传学基础进行阐述。因此,本研究的目的是鉴定自噬相关基因中的其他易感性变异及其功能意义。

首先,研究者使用免疫芯片在SLE患者中进行了基于家族的基因关联分析,并选择了关联最大的相关多态在其他队列中进行复制。分析了eQTL和ENCODE数据库中关于转录因子结合位点和细胞型特异性差异表达的公开数据集,以寻找相关调节线索。通过荧光素酶报告基因测定、凝胶迁移滞后实验(EMSA)和差异基因表达测定来测试功能效应。

在14474个样本中,研究者观察到罕见的中国人的变异基因rs933717T与SLE易感性相关(病例组0.11% vs 对照组0.87%,p = 2.36×10-10,OR = 0.13)。 rs933717风险等位基因C与MAP1LC3B表达增加相关,在SLE患者和狼疮易感小鼠中也观察到增加的MAP1LC3B mRNA。在报告基因构建中,HEK293T和Jurkat细胞系的风险等位基因能够增加荧光素酶活性达4倍。并且,HEK293T和Jurkat核提取物与风险等位基因的结合也增加。

因此,研究者通过此项研究观察到LC3B,一种广泛使用的自噬标记物,与SLE易感性之间的遗传关系。

原始出处:

Qi, Zhou, Nath, Sun.et al. A rare variant (rs933717) at FBXO31-MAP1LC3B in Chinese is associated with systemic lupus erythematosus. Arthritis Rheumatol. 2017 Oct 17. doi: 10.1002/art.40353.

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所属期刊:Arthritis Rheumatol 影响因子:6.918 期刊论坛:进入期刊论坛
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2017-10-27 6:58:48 回复

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2017-10-21 15:22:37 回复

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