加载中........
×

PNAS:哪些基因位点对紫外线特别敏感?

2019/11/19 作者:海北   来源:MedSci原创 我要评论0
Tags: 紫外敏感  

如果基因组包含对环境因素异常敏感的异常序列,那么这些序列将被用作监测个人致癌物暴露的前哨信号,并可能直接导致细胞生理上的变化,而不是通过罕见的突变起作用。

新方法adductSeqfreqSeq可以提供统计分辨率,使得我们可以在整个基因组中以单碱基分辨率对稀有病变进行定量。与紫外线(UV)诱导的环丁烷嘧啶二聚体(CPD)相比,原代人黑素细胞(而非成纤维细胞)携带自发的嘌呤位点和TG序列损伤的频率更高。

紫外线暴露表明,超热点获得CPD的频率比基因组平均频率高170倍。这些位点在黑素细胞中更为普遍。超级热点不成比例地位于基因序列附近,特别是对于RNA结合蛋白而言,最经常出现的超级热点位于2个基序内的固定位置。

其中,一个基序出现在ETS家族转录因子结合位点(已知为UV靶点),已有的数据显示其为基因组中最敏感的位点,位于mTOR / 5'末端寡嘧啶束翻译调节位点。

第二个基序出现在A2-15TTCTY,在紫外线照射后很长一段时间内会形成深色CPD”,其对于CPD的修复缓慢,并且在实验之前已经积累了CPD

在不同类型的细胞之间,作为超热点活跃的基序位置也有所不同。黑色素细胞中的CPD超级热点可以与黑色素瘤的单个基因启动子中的复发性UV特征突变,以及已知的癌症驱动因素精确对齐。

在晒伤级别的紫外线照射下,每个细胞在约20种靶向细胞途径中的每一种中都具有超热点CPD,让超热点充当表观遗传标记,造成表型不稳定。高患病率倾向于同时发生突变,这将允许肿瘤进化时使用弱驱动因子。


原始出处:

Premi S et al. Genomic sites hypersensitive to ultraviolet radiationPNAS, 2019; DOI: 10.1073/pnas.1907860116. 


本文系梅斯医学(MedSci)原创编译整理,转载需授权



小提示:78%用户已下载梅斯医学APP,更方便阅读和交流,请扫描二维码直接下载APP

所属期刊:P NATL ACAD SCI USA 期刊论坛:进入期刊论坛
版权声明:本文系梅斯MedSci原创编译整理,未经本网站授权不得转载和使用。如需获取授权,请点击

只有APP中用户,且经认证才能发表评论!马上下载

web对话