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ceRNA：从全新的视角研究<font color="red">转录</font><font color="red">组</font>

ceRNA：从全新的视角研究转录组

当我们谈到基因表达，自然离不开microRNA（miRNA）。这一类小小的非编码RNA通过与mRNA目标结合，抑制其翻译成蛋白质，从而在胚胎发育、细胞分化以及器官形成等过程中发挥重要作用。然而，事情并非如此简单。单个mRNA可能受到多个miRNA的调控，而单个miRNA能够调控多个mRNA。mRNA与miRNA之间的串扰（crosstalk）是如此复杂，又如此迷人，引无数学者竞折腰。 miR

生物通 - ceRNA，转录 - 2016-09-18

Circulation：单细胞<font color="red">转录</font><font color="red">组</font>学揭示不同器官内皮细胞的<font color="red">转录</font>特征

Circulation：单细胞转录组学揭示不同器官内皮细胞的转录特征

虽然这些功能上的差异可能被记录在转录组中，但维持EC异质性的通路和网络尚未完全明确。

MedSci原创 - 内皮细胞，转录组，单细胞RNA测序 - 2020-09-19

PNAS：上夜班使你的<font color="red">转录</font><font color="red">组</font>失调

PNAS：上夜班使你的转录组失调

内源性昼夜节律系统的错位会导致生理节律的破坏，并可能导致与夜班工作相关的健康损害的发展。然而，这背后的分子基础仍有待阐明。

MedSci原创 - 夜班，昼夜节律，转录 - 2018-05-09

SCIENCE：单细胞<font color="red">转录</font><font color="red">组</font>揭示人肾肿瘤的细胞身份

SCIENCE：单细胞转录组揭示人肾肿瘤的细胞身份

信使RNA编码细胞功能和表型。在人类癌症的背景下，它定义了恶性细胞的身份和肿瘤组织的多样性。

MedSci原创 - 肾脏，肿瘤，单细胞测序 - 2018-08-12

Blood：遗传-<font color="red">转录</font><font color="red">组</font>学分析明确关键<font color="red">转录</font>因子是人红白血病的驱动因素

Blood：遗传-转录组学分析明确关键转录因子是人红白血病的驱动因素

急性红细胞白血病(AML-M6或AEL) 是一种罕见的侵袭性血液恶性肿瘤。既往研究表明，AEL白血病细胞通常携带已知的AML相关癌基因的复杂核型和突变。

MedSci原创 - 转录因子，急性红细胞白血病，AML-M6 - 2020-05-12

Nat Biotechnol发表新空间<font color="red">组</font>学方法，同步实现<font color="red">转录</font><font color="red">组</font>和代谢<font color="red">组</font>的空间多模态精确分析

Nat Biotechnol发表新空间组学方法，同步实现转录组和代谢组的空间多模态精确分析

研究团队证明了在单个组织切片中结合SRT和MALDI-MSI并保留两种模式的特异性和敏感性的可能性，并在多巴胺和帕金森病条件下的小鼠和人类大脑样本中证明了该方法的潜力。

测序中国 - 空间多模态精确分析 - 2023-10-03

Nucleic Acids Res：空间<font color="red">转录</font><font color="red">组</font>学数据挖掘新算法——DeepST

Nucleic Acids Res：空间转录组学数据挖掘新算法——DeepST

研究团队研发了基于深度学习的空间域识别技术（DeepST）。DeepST使用预先训练好的深度神经网络模型从组织形态学信息（H&E染色图片）中提取图像特征，然后将提取的特征与基因表达和空间位置数据集成，

测序中国 - 数据挖掘，算法，空间转录组学 - 2022-10-24

J Ethnopharmacol：代谢<font color="red">组</font>学结合<font color="red">转录</font><font color="red">组</font>学揭示瓜蒌薤白汤抗慢性心肌缺血机制

J Ethnopharmacol：代谢组学结合转录组学揭示瓜蒌薤白汤抗慢性心肌缺血机制

该研究通过代谢组学结合转录组学揭示瓜蒌薤白汤抗慢性心肌缺血机制。

MedSci原创 - 中医药，代谢组学，转录组学，慢性心肌缺血，瓜蒌薤白汤 - 2022-09-21

Nat Med::血液<font color="red">转录</font><font color="red">组</font>测序可提高罕见病的诊断率

Nat Med::血液转录组测序可提高罕见病的诊断率

斯坦福大学的研究人员近日发现，整合血液样本的转录组数据有助于提高罕见病患者的诊断率，并确定新的疾病相关基因。

生物通 - 血液，转录组测序，罕见病 - 2019-08-16

Nat Med：血液<font color="red">转录</font><font color="red">组</font>测序可提高罕见病的诊断率

Nat Med：血液转录组测序可提高罕见病的诊断率

斯坦福大学的研究人员近日发现，整合血液样本的转录组数据有助于提高罕见病患者的诊断率，并确定新的疾病相关基因。

生物通 - 血液，转录组测序，罕见病 - 2019-06-26

Nat Commun：研究揭示炎症促进癌细胞<font color="red">转录</font><font color="red">组</font>改变的机制

Nat Commun：研究揭示炎症促进癌细胞转录组改变的机制

炎症影响癌症发生，进展和治疗效果，但免疫信号传导驱动癌细胞转录组改变的机制目前仍不清楚。

MedSci原创 - 炎症，p53，NF-κB - 2017-10-11

Science：开发出TT-Seq技术绘制人类瞬时<font color="red">转录</font><font color="red">组</font>图谱

Science：开发出TT-Seq技术绘制人类瞬时转录组图谱

基因之间的序列长期以来被视为“垃圾DNA”，我们如今知道它们也发挥着至关重要的功能。这些DNA区域发生的突变能够严重地对人类发育造成损害，而且可能在生命后期导致严重疾病。然而，在此之前，调节性DNA序列一直很难发现。如今，在一项新的研究中，德国慕尼黑理工大学计算生物学教授Julien Gagneur团队和德国马克斯普朗克生物物理化学研究所教授Patrick Cramer团队如今开发出一种方法可

生物谷 - TT-Seq技术，人类瞬时转录 - 2016-06-04

Cell Reports︱汤富酬研究<font color="red">组</font>与合作者绘制人类肾脏发育单细胞<font color="red">转录</font><font color="red">组</font>图谱

Cell Reports︱汤富酬研究组与合作者绘制人类肾脏发育单细胞转录组图谱

肾脏是人体最重要的内脏器官之一，对维持机体的酸碱平衡，调节水盐代谢，排泄代谢废物以及调节血压等方面都具有重要作用。过去几十年来基于小鼠模型的研究，已经相对完整地揭示了哺乳动物胚胎期肾脏的发育过程。然而由于小鼠和人类物种间差异的存在，长期以来对于人类胚胎期肾脏发育过程始终没有得到很好的说明，特别是关于肾脏发育过程中一些重要细胞类型的起源及其功能、以及参与完整肾单位发育成熟的分子调控机制等方面都亟待进

细胞 - 绘制，人类，肾脏，发育单细胞，转录组图谱 - 2018-09-28

AGING CELL：长寿基因可稳定衰老<font color="red">转录</font><font color="red">组</font>，并应对内部应激

AGING CELL：长寿基因可稳定衰老转录组，并应对内部应激

至今为止，我们关于衰老过程中转录组变化的作用和调节机制尚不清楚。研究人员已经提出，由于转录因子与年龄相关的下调，转录组在衰老期间遭受衰退。

MedSci原创 - 衰老，稳态 - 2019-02-18

单细胞转录组研究进展

   单细胞转录组分析以单个细胞为特定研究对象，提取mRNA进行逆转录、放大和高通量测序分析，能揭示该细 胞内整体水平的基因表达状态和基因结构信息，准确反映细胞间的异质性，深入理解其基因型和表型之间的相互关系，在发育生物学、基础医学、临床诊断和药物开 发等领域都发挥重要作用．本文主要介绍了单细胞转录组分析的特点和技术发展历史以及常用研究策略和不同技术的优缺点，并就其面临挑战

生物化学与生物物理学进展 - 转录组，单细胞转录组 - 2014-01-03

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