GUT：中国胃癌患者易感基因的全基因组关联及功能分析
2019-08-13 MedSci MedSci原创
研究人员确定了12个与中国人群中GC风险相关的基因，并解释了5p13.1-PRKAA1和10q23.33-noc3l在胃癌发生机制中的作用
目的遗传位点与胃癌(GC)的风险相关的潜在机制尚不清楚，近日研究人员考察了新易感基因与GC发育的相关机制。
研究人员对四项全基因组关联研究(GWASs)进行了Meta分析，包括3771例病例和5426例对照者。在靶向测序和功能注释后，进行了体外和体内实验，以确定基因变异和候选基因的功能。此外，我们从其他5项研究中选出了7035例病例和8323例对照者，对33种变异体的GC相关性进行了考察。
GWASs的Meta分析发现，在p<5×10-8时，1q22、5p13.1和10q23.33位点突变与胃癌风险相关，在p<0.05时验证了7个已知位点。对于5p13.1位点，rs59133000[C]等位基因增强NF-κB1(核因子κB亚基1)与PRKAA1启动子的结合亲和力，导致启动子活性降低，表达降低。PRKAA1基因敲除对胃癌细胞增殖和裸鼠移植瘤生长均有促进作用。对于10q23.33位点，rs3781266[C]和rs 3740365[T]风险等位基因在完全连锁不平衡状态下，分别破坏和产生了POU2F1和PAX 3的结合基序，从而增强了NOC3L的活性和表达，而NOC3L的敲除抑制了GC细胞的生长。另外发现了3q11.2(OR=1.21)和4q28.1(OR=1.14)两个胃癌风险相关位点。
研究人员确定了12个与中国人群中GC风险相关的基因，并解释了5p13.1-PRKAA1和10q23.33-noc3l在胃癌发生机制中的作用。
原始出处：
Caiwang Yan et al. Meta-analysis of genome-wide association studies and functional assays decipher susceptibility genes for gastric cancer in Chinese populations.Gut. August 5， 2019.
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