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Blood:乳腺植入相关淋巴瘤的基因突变特征

2019-12-2 作者:QQY   来源:MedSci原创 我要评论0

中心点:

JAK/STAT通路中表观遗传修饰因子和基因改变的累积或可驱动BI-ALCL肿瘤形成。

对大量BI-ALCL样本进行全外显子测序证实表观调控区存在复发性突变。

摘要:

乳腺植入相关的间变性大细胞淋巴瘤(BI-ALCL)的癌变发生机制仍不明确。为了解析其发病机制,研究人员对来源于54位BI-ALCL患者的34例BI-ALCLs(15例肿瘤,19例原位亚型)样本进行基因组图谱进行分析。

通过全外显子测序(22对肿瘤-胚系DNA)和(或)深度靶向测序(24例)发现在74%的病例的表观修饰区存在复发性突变,包括KMT2C(26%)、KMT2D(9%)、CHD2(15%)和CREBBP(15%)。KMT2D和KMT2C突变与免疫组化H3K4单甲基化和三甲基化缺失相关。

20例病例(59%)至少携带JAK/STAT信号通路上的一个基因突变,包括STAT3(38%)、JAK1(18%)、STAT5B(3%)和负性调控子样SOCS3(6%)、SOCS1(3%)和PTPN1(3%)。这些突变在肿瘤样本中比在原位样本中更常见(p=0.038)。

所有BI-ALCLs均表达pSTAT3,无论JAK/STAT信号通路的基因的突变状态如何。此外,研究人员还检测到了参与淋巴发育的EOMES基因突变(12%)、PI3K-AKT/mTOR突变(6%)和TP53功能丧失性突变(12%)。拷贝数变异(CNA)分析,在染色体2、9p、12q和21上检测到拷贝数扩增,在染色体4q、8p、15、16和20上检测到拷贝数缺失。CNA区域涵盖JAK/STAT信号通路上的基因和表观遗传调控区。

综上所述,本研究表明BI-ALCL遗传谱不仅有JAK/STAT激活突变,还有表观遗传调控区的功能丧失性变异。

原始出处:

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