Zoonoses原创论文,口腔液在急性呼吸道感染病原学监测中的应用

2023-03-20 Zoonoses 深究科学 ID: deepscience 发表于上海

口腔液作为无创、安全、便捷和高效的生物样本,尤其适用于难采血儿童、行动不便的老年人、医疗资源匮乏地区、大规模核酸检测和大规模流行病学调查,在呼吸道感染病原诊断和监测中具有很大的应用价值。

导读

近日,北京市疾病预防控制中心黄芳教授团队在Zoonoses 发表原创性论文,《Effectiveness of Oral Fluid in Pathogenic Surveillance of Acute Respiratory Infection》(口腔液在急性呼吸道感染病原学监测中的应用)。

论文在正式公布前,发表在预印本Deep Science上。

论文指出,口腔液作为无创、安全、便捷和高效的生物样本,尤其适用于难采血儿童、行动不便的老年人、医疗资源匮乏地区、大规模核酸检测和大规模流行病学调查,在呼吸道感染病原诊断和监测中具有很大的应用价值。

口腔液(Oral Fluid,OF)作为一种新型生物标本,是唾液腺分泌液和齿龈沟毛细血管渗出物的混合物,既含有感染的病毒,也含有和血液成分相同的IgM、IgG等抗体。因此,一份OF可以同时用于检测病毒核酸和抗体。新冠病毒感染大流行期间,美国、英国、日本等将OF用于新型冠状病毒核酸和抗体检测,但OF在其他常见呼吸道病原体的应用研究较少,国内尚无相关报道。

该研究首次探索OF在北京市急性呼吸道感染病原学监测中的应用,通过采集2020-2022年769例急性呼吸道感染病例咽拭子和配对OF样本,进行流感病毒和呼吸道合胞病毒等22种呼吸道传染病常见病原体核酸检测。咽拭子阳性率为29.26%,OF阳性率为20.81%,两种样本检测结果总符合率为91.55%,kappa为0.78,表明OF与咽拭子检测结果一致性极好。当咽拭子样本病原体Ct值≤30时,OF样本阳性检出率较高。OF与咽拭子样本检出不同呼吸道病原体的一致性有差异(表1),其中,检测乙型流感病毒、呼吸道合胞病毒、腺病毒和肺炎支原体结果一致性极好(kappa分别为0.92,0.89,1.00和1.00);检测肠道病毒和冠状病毒高度一致(kappa分别为0.61和0.64);而检测副流感病毒呈中度一致(kappa为0.47),检测鼻病毒一致性较差(kappa为0.40)。

流行病学特征分析显示,OF样本检测的呼吸道病原谱依次为乙型流感病毒(123/160, 76.88%)、鼻病毒(8/160, 5.00%)、冠状病毒(8/160, 5.00%)、副流感病毒(6/160,3.75%)、肺炎支原体 (5/160, 3.12%)、肠道病毒(4/160, 2.50%)、呼吸道合胞病毒(4/160, 2.50%)和腺病毒(2/160, 1.25%);≤5岁年龄组阳性率最高(2/2, 100%),其次是15-59岁(151/709,21.30%)和60岁以上(7/53, 13.21%)的年龄组;2020年12月至2021年2月,阳性率较低,2021年12月检出率上升至高峰水平,以乙型流感病毒为主(图1)。这些特征与咽拭子检测的基本一致。

这些研究结果表明,OF作为无创、安全、便捷和高效的生物样本,尤其适用于难采血儿童、行动不便的老年人、医疗资源匮乏地区、大规模核酸检测和大规模流行病学调查,在呼吸道感染病原诊断和监测中具有很大的应用价值。

表1 咽拭子与口腔液样本中不同呼吸道病原体检出情况的比较

图1 2020年12月- 2021年12月北京市不同月份多种呼吸道病原体分布情况

原始出处:

Huang Qi, et al. Effectiveness of Oral Fluid in Pathogenic Surveillance of Acute Respiratory Infection. Zoonoses, 2023.

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