Front Pharmacol:基于网络药理学、生物信息学和验证实验的石斛提取物对胰腺导管腺癌的综合分析

2023-03-22 紫菀款冬 MedSci原创 发表于上海

应用网络药理学、生物信息学、体外实验等方法,探讨了石斛有效成分石斛酚(Dendrobin A)对胰腺导管腺癌(PDAC)的作用及机制。

背景:石斛(Dendrobium nobile, D. nobile)是一种中草药,作为抗肿瘤药物受到了广泛关注,但其作用机制尚不清楚。该研究应用网络药理学、生物信息学、体外实验等方法,探讨了石斛有效成分石斛酚(Dendrobin A)对胰腺导管腺癌(PDAC)的作用及机制。

方法:利用SwissTargetPrediction和PharmMapper数据库获取Dendrobin A的潜在靶点,并从The Cancer Genome Atlas和Genotype-Tissue表达数据库中获取PDAC与正常胰腺组织之间的差异表达基因(DEGs)。基于STRING数据库构建了Dendrobin A抗PDAC靶标的蛋白-蛋白相互作用(PPI)网络。分子对接法评价Dendrobin A抗PDAC靶点。

PLAU是Dendrobin A抗PDAC的关键靶点之一,在临床组织阵列中进行免疫组化染色。最后,通过体外实验验证Dendrobin A对PLAU表达及PDAC细胞增殖、凋亡、细胞周期、迁移和侵袭的影响。

结果:共筛选出90个Dendrobin A抗PDAC基因,构建了Dendrobin A抗PDAC靶点的PPI网络。值得注意的是,PPI中有19个基因的无标度模块表明PPI具有较高的可信度。在这19个基因中,PLAU与PDAC患者恶病质状态呈正相关,与PDAC患者总生存期呈负相关。

通过分子对接,发现Dendrobin A与PLAU结合,Dendrobin A处理导致PDAC细胞PLAU表达减弱。基于临床组织阵列,与正常对照相比,PLAU蛋白在PDAC细胞中高表达,并且PLAU蛋白水平与PDAC的分化和淋巴结转移状态相关。体外实验进一步表明,Dendrobin A处理显著抑制PDAC细胞的增殖、迁移和侵袭,诱导细胞凋亡,并在G2/M期阻滞细胞周期。

结论:Dendrobin A可以PLAU为靶点,有效对抗PDAC。该研究结果为未来基于石斛的PDAC治疗提供了基础。

原始出处:

Xu X, Yu Y, Yang L, et al. Integrated analysis of Dendrobium nobile extract Dendrobin A against pancreatic ductal adenocarcinoma based on network pharmacology, bioinformatics, and validation experiments. Front Pharmacol. 2023;14:1079539. Published 2023 Mar 1. doi:10.3389/fphar.2023.1079539

版权声明:
本网站所有内容来源注明为“梅斯医学”或“MedSci原创”的文字、图片和音视频资料,版权均属于梅斯医学所有。非经授权,任何媒体、网站或个人不得转载,授权转载时须注明来源为“梅斯医学”。其它来源的文章系转载文章,或“梅斯号”自媒体发布的文章,仅系出于传递更多信息之目的,本站仅负责审核内容合规,其内容不代表本站立场,本站不负责内容的准确性和版权。如果存在侵权、或不希望被转载的媒体或个人可与我们联系,我们将立即进行删除处理。
在此留言
评论区 (1)
#插入话题
  1. [GetPortalCommentsPageByObjectIdResponse(id=2121004, encodeId=61022121004b3, content=基于<a href='/topic/show?id=8d82e952353' target=_blank style='color:#2F92EE;'>#网络药理学#</a>、<a href='/topic/show?id=a7fe6919e29' target=_blank style='color:#2F92EE;'>#生物信息学#</a>和验证实验的<a href='/topic/show?id=98eae326891' target=_blank style='color:#2F92EE;'>#石斛#</a>提取物对<a href='/topic/show?id=fd55839636c' target=_blank style='color:#2F92EE;'>#胰腺导管腺癌#</a>的综合分析, beContent=null, objectType=article, channel=null, level=null, likeNumber=76, replyNumber=0, topicName=null, topicId=null, topicList=[TopicDto(id=79523, encryptionId=8d82e952353, topicName=网络药理学), TopicDto(id=69197, encryptionId=a7fe6919e29, topicName=生物信息学), TopicDto(id=73268, encryptionId=98eae326891, topicName=石斛), TopicDto(id=83963, encryptionId=fd55839636c, topicName=胰腺导管腺癌)], attachment=null, authenticateStatus=null, createdAvatar=https://img.medsci.cn/Random/55971dc507c93968175ce7cc1e177b372a83869f.jpg, createdBy=f63e4754896, createdName=侠胆医心, createdTime=Wed Mar 22 08:32:14 CST 2023, time=2023-03-22, status=1, ipAttribution=上海)]
    2023-03-22 侠胆医心 来自上海

    基于#网络药理学##生物信息学#和验证实验的#石斛#提取物对#胰腺导管腺癌#的综合分析

    0

相关资讯

Front Mol Neurosci:淫羊藿对脊髓损伤的治疗作用及潜在机制

淫羊藿(EPI)是一种常见的中草药,对多种中枢神经系统疾病特别是脊髓损伤(SCI)具有神经保护作用。该研究通过网络药理学和分子对接分析揭示EPI治疗SCI的机制,并通过动物模型验证其疗效。

J Ethnopharmacol:四君子汤改善脾虚证肠损伤的作用机制及配伍的合理性

四君子汤(SJZD)是中医治疗脾虚证(SDS)的著名方剂。该研究旨在阐明SJZD配伍在SDS诱导肠损伤治疗中的科学意义及其微观机制。

Evid Based Complement Alternat Med:网络药理学方法探讨当归芍药散抗糖尿病肾病的作用机制

结合网络药理学探讨当归芍药散(DSS)对糖尿病肾病(DN)的治疗作用背后的机制。

J Ethnopharmacol:加味黄芪赤风汤对IgA肾病大鼠IL-17信号通路的影响

研究加味黄芪赤风汤(MHCD)治疗免疫球蛋白A肾病(IgAN)的具体作用机制。

Biosci Rep:通过网络药理学和实验验证探讨决明子调节脂质代谢的机制

多项研究评估了决明子(CS)在调节脂质代谢中的作用。然而,CS对非酒精性脂肪性肝病(NAFLD)的作用机制却很少被深入研究。该研究旨在探讨CS对NAFLD脂质代谢的调节机制。

Phytomedicine:乌梅丸通过调节RAGE信号通路减轻IBD中的血管生成和炎症

通过网络药理学和实验验证,探讨中药乌梅丸(WMW)治疗慢性溃疡性结肠炎(UC)的潜在机制。