ECCO 2023：EPIC-CD研究速递：生物标志物组合可预测接受ADA、VDZ或UST治疗的CD患者的临床和内镜缓解情况

尽管已有证据证明生物疗法能有效治疗克罗恩病（CD），但是很多患者会因时间的推移而对治疗失去应答。因此，找出可以预测治疗效果的生物标志物将具有极高的价值。既往表观基因组的相关研究将DNA甲基化差异与CD特异性表型相关联，其在分类和预测治疗反应方面显示出潜在的利用价值。

研究者前瞻性地收集和评估了184例克罗恩病成年患者在接受阿达木单抗（ADA），维得利珠单抗（VDZ）或乌司奴单抗（UST）生物治疗前（T1）和中位治疗28周（T2）后的纵向外周血DNA甲基化谱。患者来自一项探索性研究（n=88）和一项独立收集的内部验证队列研究（n=96）。采用Illumina EPIC BeadChip微阵列平台进行DNA甲基化分析。临床缓解（R）定义为内镜下完全缓解（SES-CD评分降低 ≥50%）和无类固醇临床缓解（无皮质类固醇用药的情况下HBI评分下降 ≥3分或HBI≤4分）和/或生化缓解[C反应蛋白（CRP）和粪钙卫蛋白降低≥50%或CRP ≤5 g/mL和粪钙卫蛋白≤250 μg/g]的复合。对T1采集的样品采用稳定性选择的梯度提升算法进行生物标志物鉴定和分类分析，而T2采集的样本和组间相关（ICC）数据用来评估我们识别的CpG位点的长期稳定性。

总计纳入58例ADA患者（NR=29，NNR=29）、64例VDZ患者（NR=36，NNR=28）和62例UST患者（NR=30，NNR=32）。在接受治疗前的T１时，我们在ADA组、VDZ组和USTE组分别识别出100个、22个和68个与CpG位点相关的生物标记物组合，经过验证它们可以准确地预测临床缓解和内镜缓解（AUC ADA=0.73、VDZ=0.89和UST=0.94）。值得注意的是，这些CpG位点在T1期和T2期的甲基化水平没有显著差异，这意味着无论炎症状态和治疗干预如何，其在诱导和维持治疗期间均具有稳定性。此外，这些CpG位点中的大多数（>60%）表现出长期超稳定性（ICC值≥0.90）。另外在对感兴趣的CpG进行基因注解时发现，药物特异性参与TNF信号传导、内皮细胞黏附、整合素依赖性T细胞归巢、先天免疫系统和Th17 / Treg分化，证实了每种药物的作用模式。

在这项研究中，研究者报告了3个经过验证的高度稳定的表观遗传生物标志物组合，这些生物标志物组合可预测接受ADA、VDZ或UST治疗的CD患者的临床缓解和内镜缓解情况。目前正在进行EPIC-CD和OMICROHN临床试验的其他外部验证研究和临床验证研究。