Emerg Infect Dis：葡萄球菌耐抗生素菌株可能在工厂化养猪场之间传播

家畜相关金黄色葡萄球菌（LA-SA）已在全球养猪场（IHO）饲养的猪和在IHO工作或生活的人中出现。职业接触猪的IHO工人鼻内携带金黄色葡萄球菌的风险增加，包括耐甲氧西林金黄色葡萄球菌（MRSA）、耐多药金黄色葡萄球菌（MDRSA）和LA-SA。此外，暴露于LA-SA的人有发生轻度至重度感染的风险，包括皮肤和软组织感染（SSTIs）、肺炎、心内膜炎、骨髓炎和菌血症。最近有证据表明已经出现与IHOs相关的不同克隆型。

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流行病学研究结果支持了LA-SA-CC9型在IHO工作人员及其家庭接触者之间的潜在传播，包括未成年儿童（<18岁；IHO未成年人）。流行病学研究还发现，在北卡罗来纳州高密度IHO地区，没有已知牲畜接触的社区居民中存在LA-SA CC9鼻腔携带的情况。全基因组测序（WGS）分析提供了一个描述美国LA-SA CC9的种群结构和传播动态的机会。有研究者使用WGS和系统发育分析来阐明来自北美、南美、欧洲和亚洲不同地区的金黄色葡萄球菌CC9的种群结构，并调查在北卡罗来纳州IHO猪和在IHO工作或生活在IHO附近的人中抗药性LA-SA CC9的潜在传播。该研究结果近日发表在Emerging Infectious Diseases杂志上。

研究人员近年来一直在收集猪、农场工人、农场工人的家庭成员和社区居民(包括儿童)的金黄色葡萄球菌样本，这些地区都位于北卡罗来纳州养猪最多的县。在这项研究中，他们对其中一些样本的DNA进行了测序，以确定猪和人身上发现的菌株之间的关系。他们发现这些毒株非常接近，这为猪和人之间的传播提供了证据。大多数菌株携带对多种抗生素具有耐药性的基因。

“我们发现这些与家畜相关的金黄色葡萄球菌菌株有许多基因，这些基因对美国工业化生猪生产系统中常用的抗菌药物产生耐药性，”研究第一作者、约翰霍普金斯大学Bloomberg学院环境卫生与工程系博士后研究员Pranay Randad博士说。

该研究的高级作者、同一系的副教授Christopher Heaney博士说:“这些发现为未来对美国附近社区的传播动态和与这些毒株相关的疾病负担进行调查提供了依据。”流行病学家长期以来一直怀疑金黄色葡萄球菌和其他细菌是在工厂化农场从人类传染给猪的，然后在猪体内进化出抗生素耐药性。这些动物通常被给予抗生素，以防止在密集的工厂化农场爆发疫情。耐药菌株随后可能会传染给人类，成为潜在的严重传染源。

近年来，Heaney和他的同事们一直在北卡罗莱纳(美国养猪业领先的州之一)的规模化养猪场收集猪和农场工人身上的金黄色葡萄球菌分离物。他们的研究表明，与家畜相关的金黄色葡萄球菌菌株，其中许多是耐抗生素的菌株，不仅在猪身上，还可以在农场工人、他们的家庭成员和附近居民身上发现。

在这项新的研究中，他们对49个金黄色葡萄球菌分离株进行了全基因组测序，以在DNA水平上描述这些菌株的特征，并得到它们之间更精确的关系。所有这些分离株，无论是来自人类还是猪，都属于一种被称为克隆复合物9 (CC9)的金黄色葡萄球菌菌株。

美国北卡罗来纳州人畜金黄色葡萄球菌克隆复合物（CC）9分离株群体结构的最大参考序列

“这种CC9是一种新的和新兴的金黄色葡萄球菌亚群，除了在亚洲的一些报告外，没有多少人研究过，”Randad说。

研究人员还从他们的分析中确定了来自北卡罗来纳州的CC9分离株是密切相关的，在许多情况下暗示了最近猪和人之间的传播。此外，几乎所有参与猪与人之间传播的分离菌都具有多药耐药性，这表明这些分离菌引起的疾病可能很难治疗。

这项研究的范围并不包括评估受感染社区人群中的金黄色葡萄球菌相关疾病，但一名鼻子中携带CC9隔离物的养猪场工人最近报告了一次皮肤感染。

这项研究中的参考数据集可能有助于将来调查与LA-SA CC9传播和获取相关的工人和社区健康问题，无论是在北卡罗来纳州还是在美国其他IHO密度较高的地区。

参考文献：Pranay R. Randad, Jesper Larsen, Hülya Kaya, Nora Pisanic, Carly Ordak, Lance B. Price, Maliha Aziz, Maya L. Nadimpalli, Sarah Rhodes, Jill R. Stewart, Dave C. Love, David Mohr, Meghan F. Davis, Lloyd S. Miller, Devon Hall, Karen C. Carroll, Trish M. Perl, Christopher D. Heaney. Transmission of Antimicrobial-Resistant Staphylococcus aureus Clonal Complex 9 between Pigs and Humans, United States. Emerging Infectious Diseases, 2021; 27 (3): 740 DOI: 10.3201/eid2703.191775