Am J Rhinol Allergy：MIR-17-5P在季节过敏性鼻炎病理中的作用研究
2019-01-23 AlexYang MedSci原创
作为最流行的鼻炎类型，过敏性鼻炎包括了季节过敏性鼻炎（SAR）和永久过敏性鼻炎。最近，有研究人员尝试阐释SAR的机制。研究人员从基因表达综合数据库中提取了基因芯片数据集GSE43523（包括了7个SAR鼻上皮细胞和5个非过敏性对照鼻上皮细胞）数据。基于limma包，研究人员对2个组进行差异表达分析来获得差异表达的基因（DEGs）。另外，研究人员对DEGs基因的功能进行了富集分析。结合Cytosca
作为最流行的鼻炎类型，过敏性鼻炎包括了季节过敏性鼻炎（SAR）和永久过敏性鼻炎。最近，有研究人员尝试阐释SAR的机制。
研究人员从基因表达综合数据库中提取了基因芯片数据集GSE43523（包括了7个SAR鼻上皮细胞和5个非过敏性对照鼻上皮细胞）数据。基于limma包，研究人员对2个组进行差异表达分析来获得差异表达的基因（DEGs）。另外，研究人员对DEGs基因的功能进行了富集分析。结合Cytoscape软件，研究人员对蛋白互作（PPI）网络进行了构建，并获得了一个显著的网络模块。研究人员还对转录因子靶标和miRNA靶标对进行了预测。研究发现，鼻炎和对照群体之间具有274个DEGs，包括了144个上调的基因和130个下调的基因。在建立了DEGs的PPI后，研究人员鉴定了一个显著的网络模块。在TF-miRNA靶标调控网络中，ABCA1， CPEB4， CD69， MIR-17-5P和CREB程度更高。更多的是，ABCA1和CD69在调控网络中均是MIR-17-5P的靶标。
最后，研究人员指出，CPEB4和CREB也许在SAR病理中是有作用的。另外，MIR-17-5P通过靶向ABCA1和CD69在SAR中也具有作用。
原始出处：
Liu X， Ren Y， Sun X et al. Bioinformatics-Based Approaches Predict That MIR-17-5P Functions in the Pathogenesis of Seasonal Allergic Rhinitis Through Regulating ABCA1 and CD69. Am J Rhinol Allergy. 8 Jan 2019.
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