肺动脉高压患者血小板RNA特征

2022-05-14 刘少飞 MedSci原创

肺动脉高压包括导致右心室功能障碍和过早死亡的进行性疾病。晚期检测是导致不良临床结果的重要原因。然而,目前缺乏准确预测肺动脉高压存在的生物标志物。

肺动脉高压(PH)指肺动脉压力升高超过一定界值的一种血流动力学和病理生理状态,可导致右心衰竭,可以是一种独立的疾病,也可以是并发症,还可以是综合征。肺动脉高压包括导致右心室功能障碍和过早死亡的进行性疾病。晚期检测是导致不良临床结果的重要原因。然而,目前缺乏准确预测肺动脉高压存在的生物标志物。

研究目的:在这项研究中,我们提供证据表明血小板含有独特的 RNA 谱,可用于检测肺动脉高压。

研究方法:从 177 名不同亚型肺动脉高压的流行患者以及 195 名临床上未怀疑肺动脉高压的对照中前瞻性地分离血小板 RNA。使用 SMARTer cDNA 扩增创建测序文库,并在 Illumina HiSeq 平台上进行测序。RNA测序读数被映射到人类参考基因组,并选择了跨越内含子的剪接 RNA 读数。通过方差分析统计计算差异剪接 RNA 组。使用开发(n = 213 个样本)和独立验证系列(n = 159 个样本)构建了粒子群优化 (PSO) 增强分类算法。

研究结果:我们在肺动脉高压患者(n=177)和无症状对照(n=195)的血小板中检测到总共 4014 种不同的 RNA。GSEA 基因本体分析揭示了与 RNA 加工、翻译和线粒体功能相关的基因的丰富 RNA 水平。PSO 选择的 408 个独特的差异剪接 RNA 的 RNA 组介导肺动脉高压检测,灵敏度为 93%,特异性为 62%,准确度为 77%,0.89 (95%CI 0.83-0. 93) 曲线下面积和独立验证系列中 91% 的阴性预测值。预测评分与年龄、性别、吸烟、肺动脉高压亚型以及肺动脉高压特异性药物或抗凝剂的使用无关。

研究结论:血小板 RNA-panel 可以准确区分肺动脉高压患者和无症状对照。鉴于目前的诊断延误,这项研究是进一步开发和评估基于血小板 RNA 的血液检测的起点,以最终改善肺动脉高压患者的早期诊断和临床结果。血小板 RNA 面板可以准确区分肺动脉高压患者和无症状对照。鉴于目前的诊断延误,这项研究是进一步开发和评估基于血小板 RNA 的血液检测的起点,以最终改善肺动脉高压患者的早期诊断和临床结果。血小板 RNA 面板可以准确区分肺动脉高压患者和无症状对照。鉴于目前的诊断延误,这项研究是进一步开发和评估基于血小板 RNA 的血液检测的起点,以最终改善肺动脉高压患者的早期诊断和临床结果。

 

参考文献:

Smits AJ, Arkani M, In 't Veld SGJG, Huis In 't Veld AE, Sol N, Groeneveldt JA, Botros L, Braams NJ, Jansen SM, Ramaker J, Zwaan K, Post E, Nossent EJ, Boonstra A, de Man FS, Vonk Noordegraaf A, Gomez-Arroyo J, Best MG, Wurdinger T, Bogaard HJ. Distinct Platelet RNA Signatures in Patients with Pulmonary Hypertension. Ann Am Thorac Soc. 2022 May 10. doi: 10.1513/AnnalsATS.202201-085OC. Epub ahead of print. PMID: 35537078.

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