印度突变株B.1.617,传染性增强50%,半年内已扩散至数十个国家

2021-06-07 “生物世界”公众号 “生物世界”公众号

新冠病毒变异株B.1.617,于2020年末首次在印度被发现,因此也叫做印度突变株。该突变株被发现后,迅速扩散到包括美国、新加坡、英国在内的几十个国家,并有在这些国家的部分地区成为主要流行株的趋势。并

新冠病毒变异株B.1.617,于2020年末首次在印度被发现,因此也叫做印度突变株。该突变株被发现后,迅速扩散到包括美国、新加坡、英国在内的几十个国家,并有在这些国家的部分地区成为主要流行株的趋势。并且,在此次广州疫情中,也已检测到B.1.617变异株。

目前已经鉴定出的B.1.617变异株有三种亚型:B.1.617.1(即“最早的”B.1.617)、B.1.617.2及B.1.617.3。

S基因检测以及对英国病毒样本更加详细的测序数据显示,B.1.617.2打败了B.1.617的其他两个亚型,并有取代B.1.1.7之势,成为推动英国新一波疫情的最常见流行株(B.1.1.7,2020年末在英国东南部发现的一种变异株)。英国莱斯特皇家医院顾问病毒学家 Julian Tang 认为,B.1.617.2变异株携带了名为452R和478K的突变,这两种突变都与传染性增加有关,都能改变新冠病毒用来入侵人类细胞的刺突蛋白。

一项对英国测序数据的分析显示,B.1.617.2感染病例每天的增加速度可能比B.1.1.7还快13%。5月12日发表的一份研究报告则显示,根据现有数据,B.1.617.2的传染性比B.1.1.7强50%,堪称目前最强突变株。

新冠突变的梳理:

● D614G ,2020年2月被发现,2020年6月大流行。

● B.1.1.207,2020年8月在非洲尼日利亚被发现,这种突变株的传播能力没有明显提高。

● 501Y.V2/B.1.351,即南非突变,2020年10月被发现,其刺突蛋白上有8个突变,传播能力极强,很快大流行,甚至这种突变对辉瑞和Moderna疫苗中和性增强了20~40倍。好消息是国产重组蛋白亚单位新冠疫苗(智飞生物与中科院微生物所研制)和批准上市的国产灭活新冠疫苗(北京生物制品研究所)对南非新变种仍有保护效果。

● B.1.1.7(501Y . V1),2020年10月被发现,并在不到三个月的时间内在伦敦和英格兰东南部占主导地位。随后的建模工作估计,B.1.1.7的传播率提高了约50%,这可能会使一个被感染者将病毒传播的平均人数介于0.4和0.7之间。1.7万病例分析显示B.1.1.7突变株使死亡风险增加了61%。截至2021年1月11日,已在49个国家检测到B.1.1.7突变,包括欧洲、亚洲和美洲的许多国家。B.1.1.7突变株可以被疫苗诱导的抗体中和。

● B.1.429,2020年11月在美国被发现,该突变株由五种不同的突变组成,其中三种(S13I, W152C, L452R)在病毒的S蛋白中。2021年2月底,该突变株的比例已经占到了惊人的48%,并已在至少超过40个州及20个国家发现。452R突变对中和抗体的敏感性至少降低了4倍。

● B.1.526,在纽约被发现,它占科学家共享的数据库中出现的病毒序列的大约四分之一。

● P.1及P.2,2021年1月被发现,并被确认为免疫逃逸突变株。高达60%患者可被P.1第二次感染(尚未正式发表的初步数据)。P.1和P.2抗辉瑞和Moderna疫苗疫苗中和性增强了5~7倍。令人欣慰的是,3月11日外媒报道,中国科兴的新冠疫苗对P.1及P.2突变株新冠病毒初步有效。

● B.1.617,即印度突变株,2020年末被首次发现,随后很快大流行,并有趋势成为主要流行株。

病毒突变,免疫逃逸,在学术界是司空见惯的问题。当病毒感染细胞时,在被感染细胞内表达一系列病毒蛋白,它们的蛋白质被Ⅰ类人类白细胞抗原(HLA-I)加工并呈现在宿主细胞表面。宿主细胞表面的这一组合(HLA-I+peptide)被生物体循环中的细胞毒性T细胞(CTL)识别(结合到TCR),CTL启动免疫反应,从而清除被感染细胞。因此,研究SARS-CoV-2衍生的HLA-I肽序列将有助于识别与细胞毒性T细胞活化有关的病毒表位,继而为抗病毒治疗研究、疫苗研究,提供一些新的思考。

2021年5月27日,Cell 期刊在线发表麻省理工学院和哈佛大学Broad研究所 Pardis Sabeti 团队的题为:Profiling SARS-CoV-2 HLA-I peptidome reveals T cell epitopes from out-of-frame ORFs 的研究论文。

该论文表明,SARS-CoV-2感染后,有大约25% SARS-CoV-2 HLA-I 肽组提呈的均为非经典ORF之外的抗原肽,并提示面对突变株,在下一代疫苗中,把T细胞抗原肽整合到设计中,有希望能够长效保护。

因为早期研究主要关注在结构蛋白上,而目前的无论是感染后的检查还是疫苗设计,相当于直接把这1/4重要来源的抗原肽都排除了。作者希望其研究结论有助于疫苗的进一步更新迭代。

被提呈的多种抗原肽来自于非经典ORFs

吉满生物科技(上海)有限公司,是一家专业从事生物科技前沿技术研发的高新技术企业。公司成立9年以来一直致力于慢病毒、AAV等基因递送载体的研发及应用,拥有丰富的病毒包装及改造经验。

自新冠疫情爆发以来,为助力新冠相关研究,公司紧急成立研发小组,开发出近40种突变S蛋白假病毒,重组生物素化人ACE2蛋白(Biotinylated Human ACE2 Protein),新冠病毒突触蛋白(SARS-Cov-2 Spike Protein RBD),以及新冠中和抗体检测试剂盒等一系列产品,提供新冠相关研究完整解决方案。

吉满生物开发的新冠相关假病毒,同时携带了GFP和Luciferase双标记,GFP绿色荧光观察更直观、Luciferase同时满足灵敏度和定量要求。

1. ACE2蛋白(Biotinylated Human ACE2 Protein)

2. 新冠病毒突触蛋白(SARS-Cov-2 Spike Protein RBD)

3. 新冠中和抗体检测试剂盒

4. SARS-CoV-2 S蛋白中和抗体假病毒现货

5. ACE2过表达细胞系现货

6. 中和抗体检测服务

Human ACE2 Protein,重组生物素化人ACE2蛋白相关数据展示

SARS‐CoV‐2 Spike RBD Protein,SARS‐CoV‐2 Spike RBD蛋白

新冠假病毒中和抗体相关数据展示

新冠相关蛋白产品及中和抗体检测试剂盒

新冠假病毒(可用于中和抗体效果评价)

相关过表达细胞系

版权声明:
本网站所有注明“来源:梅斯医学”或“来源:MedSci原创”的文字、图片和音视频资料,版权均属于梅斯医学所有。非经授权,任何媒体、网站或个人不得转载,授权转载时须注明“来源:梅斯医学”。其它来源的文章系转载文章,本网所有转载文章系出于传递更多信息之目的,转载内容不代表本站立场。不希望被转载的媒体或个人可与我们联系,我们将立即进行删除处理。
在此留言
评论区 (0)
#插入话题

相关资讯

新研究!辉瑞新冠疫苗或能预防印度变异病毒

辉瑞疫苗似乎可以预防印度病毒株,但是效果一般。

Nat Commun:COVID-19的爆发和干预措施对中国和美国流感的影响 

美国呼吸道标本中的流感阳性率从2020年1月20日至2020年3月13日期间的>20%下降到2020年3月22日当周的2.3%,并在4月5日之后保持在历史上较低的季节间水平。

ASCO 2021: 摘要概览与展望 18 | 新冠对乳腺癌和结直肠癌诊断的影响

有效的癌症筛查使早期癌症的发现率大幅提高,同时,改善了晚期癌症诊断的发生率。

10天共新增47例,广东本轮疫情特征:印度变异病毒引起、传播速度快!

5月21日-30日24时,广东省共报告了确诊新冠病毒肺炎病例26例,本土无症状感染者21例。10天,广东全省已新增感染者47例,且已出现5代传播个案。

Nature:新冠病毒感染后,我们自身的抗体是如何助纣为虐的

体液免疫在新冠肺炎(COVID-19)中起着两种截然相反的作用。尽管中和抗体对新冠病毒感染具有保护作用,但越来越多的证据表明体液免疫失调也有助于新冠病毒感染的特征性免疫病理。

Nat Med:植物来源新冠疫苗的1期随机试验,结果值得期待

第二剂后,CoVLP+AS03组的NAbs比新冠患者康复期血清的滴度高10倍以上。此外,穗蛋白特异性干扰素-γ和白细胞介素-4的细胞反应也都被诱导。

打开APP