奥密克戎可能是新冠病毒的终极形态,多种奥密克戎亚变种混合流行成为趋势

2022-10-01 MedSci原创 MedSci原创

奥密克戎(英文名:Omicron,编号:B.1.1.529),2019新型冠状病毒变种。最早于2021年11月9日在南非首次检测到。2021年11月26日,世界卫生组织将其定义为第五种“关

奥密克戎(英文名:Omicron,编号:B.1.1.529),2019新型冠状病毒变种。最早于2021年11月9日在南非首次检测到。2021年11月26日,世界卫生组织将其定义为第五种“关切变异株”,取名希腊字母Omicron(奥密克戎)变异株。到2022年1月4日, 世卫组织表示,已有128个国家和地区报告发现了奥密克戎变异株。

目前,奥密克戎变异株是唯一流行的新冠病毒突变株,同时它在全球已经历了多个版本(亚变体),包括从BA.1到BA.2,再到BA.2.12.1广泛流行,后来又转向BA.4/BA.5的全面流行,最高占到90%以上。最近BA.5逐渐减退,以BA.4.6, BA.5.2.7 (BF.7), BA.2.75三种亚变体流行为主。

 

 

从最近一周的数据来看,BA.5.2.7 (BF.7)虽然仅占3.4%,但是较上周2.4%,上升幅度最快,一周增长30%。BA.4.6从上周11.8%增长到12.8%,增长不足10%。而BA.2.75从1.2%增长至1.4%,上升15%左右。由此可见,BA.5.2.7 (BF.7)很有可能在未来占上风。

奥密克戎会是多种混合亚变体流行的态势吗?

我们也注意到,BA.5的消退速度远远不如此前的BA.1,BA.2,BA.2.12.1的消退速度,意味着,未来的奥密克戎很难再出现象此前的一家独大的局面,而更有可能是多种流行株混合流行为主。除非出现一种新的毒株,传播速度以及免疫逃逸均较当前毒株明显上升,这是极为困难的,毕竟现在亚变体的传播速度,已接近病毒传播的极限了。

从目前数据来看,BA.5(应该是BA.5.2.1)仍然在持续消退中,但是,BF.7,BA.4.6和BA.2.75的上升都是缓慢的。有可能随着进一步发展,BA.5.2.1,BF.7,BA.4.6和BA.2.75几种亚变体同时存在,分别占有一定的比例。当然,未来仍然可能会有更新的变体加入,组成新的流行态势,这种可能性越来越大。

奥密克戎会进化为β属冠状病毒的一个独立的亚群吗?

冠状病毒属于套式病毒目、冠状病毒科、冠状病毒属,是一类具有囊膜基因组为线性单股正链的RNA病毒,是自然界广泛存在的一大类病毒。病毒基因组5′端具有甲基化的帽状结构,3′端具有poly(A)尾,基因组全长约27-32kb,是目前已知RNA病毒中基因组最大的病毒。冠状病毒仅感染脊椎动物,与人和动物的多种疾病有关,可引起人和动物呼吸道、消化道和神经系统疾病。

根据系统发育树,冠状病毒可分为四个属:α、β、γ、δ,其中β属冠状病毒又可分为四个独立的亚群A、B、C和D群。

目前发现7种可感染人类的冠状病毒(HCoV-229E、HCoV-OC43、SARS-CoV、HCoV-NL63、HCoV-HKU1、MERS-CoV、SARS-CoV-2(新冠病毒))。而动物冠状病毒包括哺乳动物冠状病毒和禽冠状病毒。哺乳动物冠状病毒主要为α、β属冠状病毒,可感染包括蝙蝠、猪、犬、猫、鼠、牛、马等多种动物。

在全球,10%~30%的上呼吸道感染由HCoV-229E、HCoV-OC43、HCoV-NL63和HCoV-HKU1四类冠状病毒引起,在造成普通感冒的病因中占第二位,仅次于鼻病毒。其中HCoV-229E和HCoV-NL63为α属,HCoV-OC43和HCoV-HKU1为β属A亚群。而SARS-CoV归为β属B亚群,MERS-CoV归为β属C亚群。

未来SARS-CoV-2(新冠病毒)归为β属冠状病毒的哪一个亚群,还是一个新的类别,是令人关注的。

随着奥密克戎的出现,从2021年11月26日至今已超过10个月,并没有看到其它类型的变异株出现。也说明,奥密克戎在进化过程中,完全淘汰了Delta等流行株。同时,奥密克戎本身还在继续突变,直至达到某种均态,成为地球上常驻病毒,甚至是常常流行的地方流行性疾病。比较有可能的是,奥密克戎就是新冠病毒的终极形态,虽然它本身仍然在不断变异中。

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    2022-12-07 小小点心盒 来自浙江省

    谢谢

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    2022-10-02 lifestar

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    2022-10-01 yangchou

    好文章,谢谢分享。

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