美国日增超10万例,疫情再度升温:从BA.4/5再到新毒株,疫情还远未离去

2022-05-13 李晓韦 “深究科学”公众号

据WHO消息,除南非以外,有近20多国检测到奥密克戎亚型毒株BA.4和BA.5。其之所以成为主要毒株,主要是传播更快,新变异株的毒性如何尚未可知。

导读

此前声称奥密可戎是“大号流感”的比尔·盖茨这两天感染了新冠,目前症状轻微。实际上,美国正迎来新一轮的疫情。日新增人数超10万人,新冠疫情还远未结束,这主要是新的突变株一直出现。

2022年初,奥密克戎家族变异株BA.4与BA.5现身南非,逐渐成为了南非大流行的主流变异株,占据南非新冠病例的60-75%,并在全球20多个国家传播。

据WHO消息,除南非以外,有近20多国检测到奥密克戎亚型毒株BA.4和BA.5。其之所以成为主要毒株,主要是传播更快,新变异株的毒性如何尚未可知。

而导致北美疫情升温的BA.2.12.1亚型传播更快,已经逐步成为美国的主流毒株,并开始外溢到其他国家。面对“没完没了”的新冠病毒大流行,我们应该如何正确认识毒株的变异?如何在病毒不断的变异下做好防护的措施?

01

变异是永恒的话题:BA.4、BA.5的出现及其突变位点

在奥密克戎家族日益庞大的时代,BA.4、BA.5新亚型毒株未来可能会引发新一轮感染浪潮。它们是怎么来的?

2022年4月1日,南非生物信息学家埃端·威尔金森(Eduan Wilkinson)检测到了几个异常的病毒基因序列,这就是后来被国际病毒分类小组确定并命名的BA.4和BA.5,它们是奥密克戎家族中两个新的独立的谱系。

4月7日,英国健康安全研究所的一份报告显示,BA.4和BA.5两个新毒株已抵达英国。

4月14日,世界卫生组织表示,开始密切关注BA.4和BA.5亚型的传播情况。

那么,BA.4和BA.5凭借什么在一众变异亚型里“脱颖而出”?

这就要从BA.4以及BA.5的突变位点说起了。知名科普作家王宇歌表示,BA.4和BA.5有和德尔塔一模一样的突变位点L452R,还有氨基酸突变F486V和回复突变Q493R。

我们据相关资料,逐一来分析一下这三个突变点:

第一个L452突变,它是德尔塔突变株的最关键突变,让德尔塔直接具有了迅速传播的优势。不过它对免疫逃逸的影响较小,主要影响的是病毒传播的速度。

第二个F486V突变,位于病毒的刺突蛋白上,靠近刺突蛋白与细胞ACE2受体结合的位点。而新冠疫苗产生的抗体就是通过粘附在这一位点上来中和病毒的。

这个突变意味着,新冠病毒能被抗体结合的位点发生了突变,F486V可能会造成病毒进一步的免疫逃逸,因此这种突变让疫苗产生的抗体功效大打折扣。

第三个Q493R突变是一种回复突变,简单来说就是突变体经过第二次突变又完全地或部分地恢复为原来的基因型和表现型。

02

是否会掀起新一轮浪潮?BA.4和BA.5的传播性与逃逸性

说到新毒株,我们最关心的就是它有多可怕、传的有多快,疫苗还有没有用这些问题。

让我们一个一个来谈,我们先说说这两种变异株的传播速度。

BA.4出现于2021年12月中旬,而BA.5在2022年1月初出现。南非的研究人员发现,从那时起,这两个变异株的流行率一直处于上升趋势,并且在4月底占据南非新冠病例的60-75%,成为了南非的主流毒株,其传播轨迹如下。

BA.4和BA.5在南非的传播轨迹

据《自然》报道,南非约翰内斯堡威特沃特斯兰德大学的病毒学家Penny Moore表示,南非正在进入新一波新冠浪潮,而这一波疫情的“凶手”无疑就是BA.4和BA.5。

研究人员估计,南非BA.4和BA.5病例数的增长情况不容乐观,目前平均每天新增近5000例,而3月份新增的低点约为1200例,这些变体的传播速度略快于BA.2亚型,值得引起人们的重视。

4月29日,CERI发布的预印本研究数据表明,相较于奥密克戎毒株BA.2,BA.4和BA.5比它分别快8%和12%。而相对于奥密克戎,BA.2的每日增长优势为7%。

BA.4在南非豪登省的流行率近70%

BA.5在南非夸祖鲁纳塔尔省的流行率近60%

为什么BA.4和BA.5的传播性更强呢?

有一种可能是,BA.4和BA.5变种更善于逃避免疫反应,从而使它们能够感染已经具有免疫力的人。究其根本,这两种毒株能够逃逸抗体,是因为上文讲到的F486V突变点的特性。

那么,针对逃逸性如此强的BA.4和BA.5,我们现有的疫苗还有用吗?

答案是肯定的。北京大学病毒学家谢晓亮也发现,由BA.1感染引发的抗体对BA.4和BA.5的效力较低。通俗一点说,通过接种疫苗来获得的抗体,比自然免疫(自然感染)产生的抗体更能对抗新的BA.4和BA.5毒株。

目前,南非住院人数正缓慢上升,但研究人员认为,现在判断BA.4和BA.5是否会给医疗系统带来很大压力还为时过早。南非的高人口免疫力是否会让南非的医疗系统紧张起来,这是我们接下来需要关注的重点。

03

BA.2.12.1毒株席卷纽约,Delta毒株从未消失

除了上文提到的BA.4和BA.5,还有一种来自北美的变异毒株BA.2.12.1也逐渐猖獗。

研究人员发现,BA.2.12.1与BA.4和BA.5在相同的地方有刺突蛋白突变(BA.4和BA.5是刺突蛋白452R;BA.2.12.1是刺突蛋白452Q)。这些变异株的出现表明奥密克戎谱系正在通过侵蚀免疫力取得“进化”,并逐渐填补初代奥密克戎毒株的一些漏洞。

而近期谢晓亮和肖俊宇的文章,讲到了今天我们所提到的几位新晋“毒星”的免疫逃逸性。

研究发现,BA.2及其子毒株具有最强的ACE2受体结合力,而BA.4和BA.5的ACE2结合却最弱(比BA.2低10倍),原因在于刺突蛋白F486V和R493Q两个突变,这一发现显示BA.4和BA.5的传播效率可能不如BA.2.12.1。

但上文我们刚刚才提到过,BA.4和BA.5的传播速度约比BA.2快8-10%,也就是说保守而言BA.2.12.1起码比现有的BA.2毒株传播速度快10%以上。

当然,研究人员还表明,不能排除新冠病毒家族的“远房亲戚”也来凑合这场变体大会,就像之前的Alpha、Delta和Omicron。

比如Delta毒株,它并没有完全消失,可能还会卷土重来。

以色列的科学家分析了当地的废水,检测到德尔塔“隐秘传播”的痕迹,他们预计在北半球的夏季这种变异株的感染会增加,而随着全球对奥密克戎及其家族的免疫力增加,Delta的后代也可能会卷土重来。

最后,附上谢晓亮教授的这篇文章总结出的三个结论:

针对BA.1既往感染产生的中和抗体,Omicron可以持续演化出针对性的突变以实现免疫逃逸;

这种持续演化的现象对新冠病毒群体免疫造成了严重威胁;

基于BA.1的疫苗加强针设计可能无法提供广谱的保护效力。

由上可知,我们还不能轻视新冠病毒的变异,面对无时不刻在“进化”的毒株,我们唯一能做的就是做好物理防护、积极接种疫苗,也期待广谱疫苗的研发和上市,能更好地对抗变异毒株的侵害。

 

参考资料

1. https://www.nature.com/articles/d41586-022-01240-x.

2. https://www.nature.com/articles/d41586-022-01069-4.

3. 奥密克戎毒株BA.5亚型,再传一国. 央视财经.

https://mp.weixin.qq.com/s/a_Av3np05Pyxbt4PFcnz3Q.

4. Continued Emergence and Evolution of Omicron in South Africa:New BA.4 and BA.5 lineages.medRxiv.MEDRXIV-2022-274406v1-deOliveira:(2022).

https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2022.05.01.22274406v1.

5. 南非疫情卷土重来,每6个月出现一个波峰,会成为常态吗?. 医学界.

https://3g.163.com/dy/article/H65AML7T0514AD1K.html.

6. BA.2.12.1 BA.4 and BA.5 escape antibodies elicited by Omicron BA.1 infection.

https://doiorg/1021203/rs3rs-1611421/v1.

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