Nat commun：从两个主要的来源的肾癌细胞系分析可以成功的进行基于基因组的细胞系选择
2017-05-16 AlexYang MedSci原创
癌细胞系的利用可以被相似性的内源性肿瘤细胞影响。最近，有研究人员将来自癌症细胞系百科和COSMIC细胞系工程的来源于肾的65个细胞系的基因组数据与来源于肿瘤基因组计划的3种肾癌细胞亚型进行了比较，这3中肾细胞亚型分别为：肾透明细胞癌（ccRCC），肾乳头状细胞癌(pRCC)和肾难染性细胞癌（chRCC）。研究发现，聚类拷贝数改变表明了大多数细胞系类似于ccRCC，有一些（包括一些经常被用于ccRC
癌细胞系的利用可以被相似性的内源性肿瘤细胞影响。最近，有研究人员将来自癌症细胞系百科和COSMIC细胞系工程的来源于肾的65个细胞系的基因组数据与来源于肿瘤基因组计划的3种肾癌细胞亚型进行了比较，这3中肾细胞亚型分别为：肾透明细胞癌（ccRCC），肾乳头状细胞癌(pRCC)和肾难染性细胞癌（chRCC）。
研究发现，聚类拷贝数改变表明了大多数细胞系类似于ccRCC，有一些（包括一些经常被用于ccRCC模型）细胞系类似于pRCC，但是没有细胞系类似于chRCC。人类ccRCC肿瘤与细胞系聚类表现了更加具有侵入性疾病的临床和基因组特性，表明了细胞系能够最好的代表侵入性肿瘤。研究人员通过数据库之间的一致性，分层分析了重要肾癌基因的突变和拷贝数改变，并且将细胞系基于基因表达分类为懒惰性亚型和侵入性亚型。最后，研究人员指出，这些结果可以帮助研究者分析合适的肾癌细胞系。
原始出处：
Rileen Sinha， Andrew G. Winer， Michael Chevinsky et al. Analysis of renal cancer cell lines from two major resources enables genomics-guided cell line selection. Nat commun. 10 May 2017.
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