PNAS:郭峰团队开发智能化微流控平台,改善癌症免疫治疗

2022-12-02 王聪 “生物世界”公众号 发表于上海

该研究开发了一种平台工具,将微流控与深度学习技术相结合,有效地识别促进T细胞肿瘤浸润和提高癌症免疫治疗效果的表观遗传药物,从而帮助改善癌症免疫治疗。

免疫细胞浸润和细胞毒作用在炎症和免疫治疗中起着至关重要的作用。然而,目前的癌症免疫治疗筛选方法忽略了T细胞穿透肿瘤间质的浸润能力,从而极大地限制了实体瘤有效治疗的发展。

近日,美国印第安纳大学伯明顿分校郭峰团队在 PNAS 期刊发表了题为:Microfluidics guided by deep learning for cancer immunotherapy screening 的研究论文。

该研究开发了一种平台工具,将微流控与深度学习技术相结合,有效地识别促进T细胞肿瘤浸润和提高癌症免疫治疗效果的表观遗传药物,从而帮助改善癌症免疫治疗

该论文的通讯作者郭峰教授表示,该研究开发的平台非常独特,能够观察不同的疗法如何影响对目标癌细胞的杀伤,甚至是T细胞肿瘤浸润情况。

微流控(microfluidics),也被形象地成为芯片实验室(lab-on-a-chip),是在微观通道中进行流体操作的技术,本质上是将不同的实验室功能缩小到一个微芯片上。

深度学习(Deep Learning)是受生物神经网络启发的基于计算系统的机器学习,属于人工智能(AI)技术。

实体瘤占据了人类癌症的绝大部分。然而,目前的癌症免疫治疗筛查方法忽略了T细胞等免疫细胞穿透实体瘤组织的能力。癌症免疫疗法取得了非常大的成功,但对于实体瘤而言,仍然面临着巨大挑战,很难开发出既能浸润到实体瘤组织中,又能有效杀伤肿瘤细胞的有效疗法。

在这项研究中,研究团队希望开发出一种新的肿瘤免疫治疗筛查平台,可以动态跟踪T细胞的肿瘤浸润及对肿瘤细胞的杀伤情况,从而能够以高通量和自动化的方式扫描许多潜在抗癌药物。

研究团队利用临床数据训练了一种深度学习算法,包括实体肿瘤的数字化图像和患者生存数据。然后,他们将这种深度学习算法与微流控平台集成,提出了一个自动化高通量微流控平台,用于实时跟踪三D肿瘤培养中T细胞浸润和细胞毒作用的动态。该平台可以模拟肿瘤免疫,并筛选新的免疫疗法,促进T细胞肿瘤浸润和杀死癌细胞。

通过使用基于临床数据驱动深度学习方法的临床肿瘤浸润淋巴细胞(TIL)评分分析仪,该平台可以根据T细胞浸润模式评分来评估每种治疗的疗效。

使用该平台,研究团队对一个药物库进行了筛选,发现一种表观遗传药物——赖氨酸特异性组蛋白去甲基化酶1抑制剂(LSD1i),可以有效促进T细胞肿瘤浸润,并与免疫检查点抑制剂(anti-PD1)联合使用,在体内提高癌症治疗效果。

总的来说,该研究开发了一种用于筛选T细胞-实体瘤相互作用的自动化系统和策略,以高通量筛选肿瘤免疫疗法及联合疗法。

研究团队表示,这种智能微流控平台,对于解决实体瘤免疫治疗具有很大的潜力。此外,该平台还可以用于肿瘤学以外的领域,例如免疫学、神经学、微生物学、组织工程、再生医学、转化医学等。这项研究代表了科学于技术的强大力量,具有改变医学研究的潜力。

原始出处:

Zhang A, et al., Microfluidics guided by deep learning for cancer immunotherapy screening. PNAS,2022.

版权声明:
本网站所有内容来源注明为“梅斯医学”或“MedSci原创”的文字、图片和音视频资料,版权均属于梅斯医学所有。非经授权,任何媒体、网站或个人不得转载,授权转载时须注明来源为“梅斯医学”。其它来源的文章系转载文章,或“梅斯号”自媒体发布的文章,仅系出于传递更多信息之目的,本站仅负责审核内容合规,其内容不代表本站立场,本站不负责内容的准确性和版权。如果存在侵权、或不希望被转载的媒体或个人可与我们联系,我们将立即进行删除处理。
在此留言
评论区 (0)
#插入话题

相关资讯

别再吃维生素片了!最新研究:或会导致癌症发生率增加27%,脑转移风险加2倍多

维生素B3(烟酸)在人体内的一种存在形式——烟酰胺核苷(Nicotinamide riboside, NR)如果补充不当/过度,反而会增加罹患严重疾病的风险,包括癌症的发生及转移。

Cancer Res:基于长读长测序准确全面检测癌症基因融合事件的新方法:FusionSeeker

基于模拟和三个癌细胞系的数据,该研究证明了FusionSeeker在检测基因融合事件方面优于现有方法。

CAR-T之父Carl June点评:超越癌症,CAR-T成功治疗红斑狼疮

目前一共有六种经过FDA批准上市的CAR-T细胞疗法,用于治疗癌症。这些CAR-T疗法彻底改变了某些B细胞白血病、淋巴瘤和其他血液类癌症的治疗方法,让许多原本无望得到长期缓解的癌症患者得以康复。

Nature:叶酸转运蛋白为抗癌药提供线索,或推动癌症免疫疗法成功

鉴于SLC19A1在CDN、叶酸以及抗叶酸跨膜转运中的重要功能,对其底物识别机制的研究将有助于SLC19A1相关疾病的机理分析和潜在药物的开发及优化。

Advanced Functional Materials:铁死亡新应用:我国学者开发基于铁死亡的癌症诊断和协同疗法

各种铁基纳米材料已被开发用于癌症的治疗和诊断,这不仅是因为铁死亡作用、较好的生物相容性和低成本优势,还因为铁基纳米材料优异的物理化学性质。