J Dent Res：研究揭示人和小鼠唾液基因调控的综合表观遗传图谱
2019-03-24 不详 网络
大量研究进行了鉴定与唾液腺发育和病理生理学相关的全基因组基因表达谱。然而，关于控制唾液腺基因表达的调节因子知之甚少。我们整合了来自DNase1数字基因组足迹，RNA-seq和基因表达微阵列的数据，以全面表征控制健康下颌下腺唾液腺基因表达的顺式和反式调节成分。研究人员对32个人组织和87个小鼠组织进行分析以鉴定驱动唾液腺基因表达的高表达和组织富集的转录因子。 RNA分析后，通过免疫组织化学证实了39
大量研究进行了鉴定与唾液腺发育和病理生理学相关的全基因组基因表达谱。然而，关于控制唾液腺基因表达的调节因子知之甚少。我们整合了来自DNase1数字基因组足迹，RNA-seq和基因表达微阵列的数据，以全面表征控制健康下颌下腺唾液腺基因表达的顺式和反式调节成分。
研究人员对32个人组织和87个小鼠组织进行分析以鉴定驱动唾液腺基因表达的高表达和组织富集的转录因子。 RNA分析后，通过免疫组织化学证实了39种唾液转录因子的蛋白质表达水平和亚细胞定位。这些表达分析显示唾液腺高度表达与内质网应激，人T细胞淋巴细胞病毒1表达和Epstein-Barr病毒再激活相关的转录因子。进行DNase1数字基因组足迹深度为333,426,353读数并用于产生唾液腺基因调控网络，其描述了单核苷酸分辨率下唾液腺的全基因组染色质可及性和转录因子结合。对DNase1基因调控网络的分析鉴定了PLAG1，MYB和其他与平衡染色体易位和唾液腺肿瘤相关的其他转录因子之间的密集互连。
总的来说，这些分析提供了唾液腺顺式和反式调节因子的综合图谱，并突出了已知的异常调节的影响唾液腺的疾病通路。
原始出处：
Michael DG, Pranzatelli TJF, et al., Integrated Epigenetic Mapping of Human and Mouse Salivary Gene Regulation. J Dent Res. 2019 Feb;98(2):209-217. doi: 10.1177/0022034518806518. Epub 2018 Nov 4.
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