Clin Infect Dis:SARS-COV-2感染患者的定量检测和病毒载量分析

2020-04-02 网络 网络

冠状病毒疾病2019(COVID-19)已成为国际关注的公共卫生紧急情况。一种新的冠状病毒SARS-COV-2被确定为2019年COVID-19的病原体。

冠状病毒疾病2019(COVID-19)已成为国际关注的公共卫生紧急情况。一种新的冠状病毒SARS-COV-2被确定为2019年COVID-19的病原体。目前,我国及世界各国将定性核酸检测作为COVID-19病原学诊断的金标准,但在临床和流行病学高度疑似的病例中存在核酸检测阴性的问题以及确诊病人出院2周复查发现核酸"复阳"的报道,广泛应用的逆转录PCR(RT-PCR)方法在临床诊断和治疗方面有一定的局限性。多项研究表明,微液滴数字PCR(ddPCR)具有绝对定量的优点,对病毒检测比RT-PCR更敏感。

本研究采用ddPCR和RT-PCR对76例COVID-19确诊患者的323例标本(鼻拭子、咽拭子、痰、血、尿)进行分析。同时获取临床和影像学资料进行临床分期。

结果发现,在95例经两种方法检测均为阳性的样品中,RT-PCR的周期阈值(Ct)与ddPCR的拷贝值高度相关。用RT-PCR检测的4(4/161)阴性和41(41/67)单基因阳性样本根据ddPCR检测为阳性,病毒载量从11.1到123.2 copies/test不等。因此,两种方法均可提供较为准确的结果,但ddPCR在低病毒载量中更有优势且可提供病毒载量数值。

呼吸道样本中,痰中的平均病毒载量(17429±6920 copies/test)明显高于咽喉拭子(2552±1965 copies/test,p<0.001)和鼻拭子(651±501 copies/test,p<0.001),痰更能够反应体内病毒复制水平。此外,疾病早期和进展期的病毒载量显着高于恢复期(46800±17272 vs 1252±1027,p<0.001),早期诊断隔离有助于控制疾病。

定量监测呼吸道样本中的病毒载量有助于评估疾病进展,特别是在低病毒载量的情况下。

原始出处:

Fengting Yu, Liting Yan, Nan Wang, Quantitative Detection and Viral Load Analysis of SARS-CoV-2 in Infected Patients. Clinical Infectious Diseases, 2020 March. Doi: 10.1093/cid/ciaa345.

 

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