Sci Rep：膀胱癌中作为预后因子的免疫相关基因鉴定
2020-11-25 AlexYang MedSci原创
膀胱癌是全球最常见的癌症之一。免疫反应和免疫细胞浸润在肿瘤进展中起着关键的作用。在过去十年，免疫治疗在膀胱癌方面取得了突破性的成就。
膀胱癌是全球最常见的癌症之一。免疫反应和免疫细胞浸润在肿瘤进展中起着关键的作用。在过去十年，免疫治疗在膀胱癌方面取得了突破性的成就。
最近，有研究人员通过使用edgeR软件包坚定了膀胱癌中的差异表达基因和免疫相关基因（DEIRGs），并使用基因本体注释和KEGG途径分析对DEIRGs进行了功能富集分析。研究人员还通过单变量Cox回归分析确定了生存相关的IRGs，并通过单变量COX回归分析建立了预后模型，且使用了基于GEO数据库的验证性预后模型进行了验证。研究人员根据免疫细胞浸润的风险评分中值和临床病理分析，将患者分为高危组和低危组，并构建了生存相关IRGs和潜在转录因子的调控网络，用来调查生存相关IRGs的潜在调控机制。最后用Nomogram和ROC曲线验证模型的准确性。研究结果表明，共发现了259个差异表达的IRGs。对IRGs的KEGG通路分析显示，"细胞因子-细胞因子受体相互作用 "通路是最显著富集的通路。研究人员选取13个与生存相关的IRGs建立了对膀胱癌的预后指数。在TCGA预后模型和GEO验证模型中，高风险分的患者与低风险分组相比预后更差。高风险患者中巨噬细胞的浸润水平更高。OGN、ELN、ANXA6、ILK和TGFB3确定为网络中生存相关核心IRGs。另外，EBF1、WWTR1、GATA6、MYH11和MEF2C参与了这些生存相关核心IRGs的转录调控。
相关关键基因的表达水平
最后，研究人员指出，他们的研究发现了几个具有临床意义的生存相关IRGs，并首次建立了膀胱癌结果评价的预后指标。
原始出处：
Jie Zhu， Han Wang， Ting Ma et al. Identification of immune-related genes as prognostic factors in bladder cancer. Sci Rep. Nov 2020
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#相关基因#
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#预后因子#
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#膀胱癌# 憋尿会引起膀胱炎，所以最好不要养成憋尿的习惯。
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膀胱癌真怪，明明是免疫敏感性肿瘤，为什么PD-1治疗效果不好呢？难道靶点不对？将来CD47会不会有效
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