Int J Pediatr Otorhinolaryngol：过敏性鼻炎中致病性基因和上游调控因子鉴定
2018-11-11 AlexYang MedSci原创
过敏性鼻炎（AR）是老年人中不可逆转失明的主要起因，最近，有研究人员鉴定了AR中的关键基因和上游调控因子。研究人员利用来源于GEO数据库中的AR基因芯片数据进行了整体的分析来筛选AR致病性基因，并利用GO分析和KEGG富集分析对差异化表达基因（DEGs）进行了功能注释和途径分析。研究人员构建了AR特异性转录调控网络来发现关键的和差异化表达的转录因子（TFs），并对DEGs进行了生物信息学验证。研究
过敏性鼻炎（AR）是老年人中不可逆转失明的主要起因，最近，有研究人员鉴定了AR中的关键基因和上游调控因子。
研究人员利用来源于GEO数据库中的AR基因芯片数据进行了整体的分析来筛选AR致病性基因，并利用GO分析和KEGG富集分析对差异化表达基因（DEGs）进行了功能注释和途径分析。研究人员构建了AR特异性转录调控网络来发现关键的和差异化表达的转录因子（TFs），并对DEGs进行了生物信息学验证。研究人员在2个GEO数据库中得到了相关数据，并在AR和正常对照（NC）之间鉴定了793个DEGs（460个上调，33个下调）。在GO分析和KEGG分析之后，研究发现慢性炎症响应和MAPK信号途径在DEGs中显著富集，并检测到了6个表达基因（CLC， CST1， CRTAM， ILK， STAT1和POSTN）。另外，上述6个基因在GEO：GSE51392数据库中具有相同的模式。
最后，研究人员指出，CLC， CST1和STAT13个基因的异常表达可能参与了AR的致病过程。AP-1通过调控CST1和CLC与AR相关。研究人员指出，他们的发现对开发新的生物标记做出了贡献，并阐释了潜在的病理机制，并为AR新治疗靶标打下基础。
原始出处：
Lei Y， Guo P， An J et al. Identification of pathogenic genes and upstream regulators in allergic rhinitis. Int J Pediatr Otorhinolaryngol. Dec 2018.
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