JCLA：BCR ABL1p210/p190融合基因转录本定量的方法的制定和评价
2019-01-18 MedSci MedSci原创
在BCR ABL1融合基因(FG)转录本检测中，标准发挥着重要作用。然而，实验室广泛使用的标准主要是基于质粒或cDNA，不能准确反映RNA提取和cDNA合成的过程。因此，本研究的目标是开发基于组装RNA的p210和p190 BCR ABL1FG转录本定量标准。 研究人员采用重叠聚合酶链反应(PCR)技术，首先将p210或p190 BCR ABL1FG转录本片段与4个对照基因(CGs;ABL1
在BCR ABL1融合基因(FG)转录本检测中，标准发挥着重要作用。然而，实验室广泛使用的标准主要是基于质粒或cDNA，不能准确反映RNA提取和cDNA合成的过程。因此，本研究的目标是开发基于组装RNA的p210和p190 BCR ABL1FG转录本定量标准。
研究人员采用重叠聚合酶链反应(PCR)技术，首先将p210或p190 BCR ABL1FG转录本片段与4个对照基因(CGs;ABL1, BCR, GUSB, B2M)生成p210FG CG和p190FG CG。随后，利用组装RNA技术，制备p210FG CG和p190FG CG组装RNA以及p210FG CG和p190FG CG标准，其值由digital
PCR (dPCR)指定。
结果显示，p210FG CG和p190FG CG标准稳定均匀，与r2 > 0.98呈显著线性关系。在全国52个实验室进行的田间试验表明，p210样品中BCR ABL1值变异系数(CV%)为58.6%，为129.6%，p190样品中变异系数(CV%)为73.2%，为194.0%。相比之下，p210和p190样品在使用p210FG CG和p190FG CG标准时，BCR ABL1值CV%分别下降到35.6% 124.9%和36.6% 170.6%。另外，在p210和p190样品中，33.3%(3/9)的CV%值<50.0%，而在p210FG CG和p190FG CG标准中，44.4%(4/9)和77.8%(7/9)的CV%值较低。
研究结果表明，使用p210FG CG或p190FG CG标准，尤其是p190FG CG标准，显著降低检测BCR ABL1转录本的总变化率。
原始出处：
Yu Fu, Rui Zhang, Qisheng Wu, Development
and evaluation of armored RNA‐based standards for quantification of BCR‐ABL1p210/p190
fusion gene transcripts
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