论文解读 | Jinsong Lu/Wenjin Yin教授团队：染色体不稳定性评分模型在乳腺癌预后评估与免疫微环境分析中的应用

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乳腺癌是全球女性发病率最高的恶性肿瘤，其高度异质性给诊疗带来巨大挑战。尽管化疗、靶向及内分泌治疗不断进步，耐药所致的疾病进展与远处转移仍是威胁患者生存的“深水区”。近年来，免疫检查点抑制剂为患者带来新希望，但如何筛选免疫治疗获益人群，仍缺乏强力的生物标志物。

近日，来自上海交通大学的Jinsong Lu/Wenjin Yin教授团队在本刊发表题为“Leveraging a chromosomal instability-based signature to predict the prognosis and immune landscape of breast cancer”的研究论文。该研究创新构建了基于染色体不稳定性的13基因评分模型（CIN score），为乳腺癌个体化精准治疗提供了新的量化工具（图1）。

图1 本研究技术路线图（原文中Figure 1）

1. CIN score的构建：从CIN25特征到13基因模型

染色体不稳定性是癌症的重要标志，约90%的实体瘤存在非整倍体改变。既往CIN25基因特征虽可反映CIN水平，但临床应用仍显繁琐。研究团队首先通过非监督共识聚类，依据CIN25特征将TCGA-BRCA队列分为两个亚型，发现高表达CIN基因的群体预后显著较差。随后，利用LASSO回归与多变量Cox分析筛选出13个核心基因（SHCBP1、GABRQ、KLHDC7B、FABP7、NEK10、TPRXL、NCCRP1、IFNG、UPK1B、CDH19、TCN1、PAGE5、CSN3），构建CIN score模型。

2. CIN score的预后价值与临床评估

CIN score展现出良好的预测稳定性。在TCGA及外部METABRIC数据库中，高CIN score均显著关联较短的总生存期与更高的复发风险，其预测1年总生存的曲线下面积达0.796，预测效能良好（图2）。同时，高评分与病理分期较晚、肿瘤直径较大（T2–T4）及淋巴结转移（N1–N3）等不良临床特征密切相关。结合年龄、分期等因素构建的诺莫图，其预测一致性显著优于单纯临床参数模型，为临床提供了直观的量化工具。

图2 CIN评分与患者生存预后的关系（原文中Figure 4G、H）

3. CIN score与肿瘤免疫微环境的关联

研究揭示了CIN score与肿瘤免疫微环境特征的关联。功能富集分析显示，高CIN score组主要富集于E2F靶点、G2M检查点等细胞周期通路；低CIN score组则呈现活跃的免疫响应特征，如干扰素-γ反应与炎症反应。通过多种算法解析免疫微环境发现，低CIN score组不仅浸润更丰富的CD8⁺ T细胞、M1型巨噬细胞等抗肿瘤免疫细胞，其PD-1、CTLA-4等9个免疫检查点基因的表达也显著上调，提示该群体更可能从现有免疫治疗中获益。此外，药敏分析显示，高CIN score组对紫杉醇、顺铂等化疗药，以及他莫昔芬、奥拉帕利等内分泌和靶向药物的敏感性普遍更低。这表明低CIN score患者具有更具免疫活性的“热肿瘤”特征，治疗响应前景更优。

综上所述，本研究首次系统解析了乳腺癌中CIN25的转录组景观，并精炼出13基因评分系统。CIN score不仅是精准的预后指标，更是连接染色体变异与肿瘤免疫逃逸的重要桥梁。未来，通过PCR技术检测这13个基因，有望为乳腺癌患者绘制出更精准的“诊疗地图”。

文章来源

免费全文下载链接：

https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2352304225004131

引用这篇文章：

Wang H, Dai H, Wang Y, et al. Leveraging a chromosomal instability-based signature to predict the prognosis and immune landscape of breast cancer. Genes Dis. 2026;13(3):101924.