Nat Commun:跨种族全基因组关联荟萃分析鉴定乳腺癌风险位点

2021-07-09 xiaozeng MedSci原创

乳腺癌作为全球女性中最常见的癌症之一,在2018年里其新增病例为210万,死亡病例627,000例。

乳腺癌作为全球女性中最常见的癌症之一,在2018年里其新增病例为210万,死亡病例627,000例。研究显示,遗传因素对乳腺癌的发病风险具有显著贡献,但目前尚未完全阐明其相关的分子机制。

既往研究显示,全基因组关联研究(GWAS)已成功识别了该疾病常见的低外显率的约200个遗传突变风险位点。这些确定的风险位点也为乳腺癌的发生发展相关机制提供了线索。


在该研究中,研究人员采用跨种族GWAS方法描述了乳腺癌的风险位点。研究人员首先从非洲人群的GWAS荟萃分析(9241例病例和10193例对照)中鉴定出了与乳腺癌相关的突变,随后采用来自乳腺癌协会的欧洲人群GWAS数据(122977例病例和105974例对照)。

结果显示,该跨种族方法在基因组上确定了四个总体乳腺癌风险位点(1p13.3、5q31.1、15q24和15q26.3)和两个雌激素受体阴性乳腺癌相关风险位点(1q41和7q11.23)。


进一步的研究发现,有四个单核苷酸多态性(SNP)位于基因的内含子内,四个基因分别为KCNK2、C5orf56、SCAMP2和SIN3A,而其他相关SNP位于基因GSTM4、AMPD2、CASTOR2和RP11-168G16.2的附近。

跨种族荟萃分析发现新的乳腺癌风险位点

总而言之,该研究结果揭示,在非洲人群和欧洲人群中具有一致关联性的乳腺癌风险位点。该研究也表明,跨种族的分析有助于提高对乳腺癌遗传学的理解并确定相关因果变异。


原始出处:

Adedokun, B., Du, Z., Gao, G. et al. Cross-ancestry GWAS meta-analysis identifies six breast cancer loci in African and European ancestry women. Nat Commun 12, 4198 (07 July 2021).

 

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