研究表明：龟类也可能是新冠病毒的潜在中间宿主
2020-03-03 春雨医生 春雨移动健康
继蝙蝠、穿山甲之后，2月26日，暨南大学吴建国课题组联合湖北医药学院附属人民医院的刘龙在《journal of medical virology》发表文章称，龟类（西部锦龟、绿海龟、中华鳖）也可能是将新冠病毒传播给人类的潜在中间宿主。34121583219385288（图源：journal of medical virology）该项研究使用系统的比较和分析预测冠状病毒刺突蛋白的受体结合域（R
继蝙蝠、穿山甲之后，2月26日，暨南大学吴建国课题组联合湖北医药学院附属人民医院的刘龙在《journal of medical virology》发表文章称，龟类（西部锦龟、绿海龟、中华鳖）也可能是将新冠病毒传播给人类的潜在中间宿主。
（图源：journal of medical virology）
该项研究使用系统的比较和分析预测冠状病毒刺突蛋白的受体结合域（RBD）与宿主受体血管紧张素转换酶2（ACE2）之间的相互作用，研究重点是比较新冠病毒（SARS-CoV-2）与SARS病毒、蝙蝠SARS样CoV和其他冠状病毒的刺突序列，从而有助于分析病毒的进化及寻找可能的病毒库。此外，对ACE2结构和结合基序比对的分析，有助于提供线索来区分潜在宿主。
全球防控形势严峻，病毒溯源至关重要
自2019年12月湖北武汉爆发不明原因肺炎疫情至2020年2月27日，据国家卫健委官网数据，新冠肺炎在中国已经造成78824例确诊病例、2788例死亡病例；而在全球范围内，据世界卫生组织统计，中国以外国家和地区已确诊3664例，死亡57例。
世界卫生组织总干事谭德塞博士在2月27日的媒体通报会上指出，过去两天，世界其它地区报告的新增病例数已经超过了中国的新增病例数。这种病毒具有大流行潜力，任何国家都不应侥幸以为本国不会有病例。
而在国内，在经历确诊病例连续下降以后，26日，湖北以外30个省区市和新疆建设兵团新增确诊病例出现反弹，从25日的5例增长到24例。
因此，不管是中国地区，还是全球范围，新冠肺炎的防控形势仍是紧张严峻的，病毒溯源工作的尽快推进，对揭示病毒来源及其进化规律，消除疫情源头，防止疫情扩散都非常重要。
1月23日，中科院武汉病毒所石正丽团队在bioRxiv预印版平台上发表文章《Discovery of a novel coronavirus associated with the recent pneumonia outbreak in humans and its potential bat origin》，提出新型冠状病毒或来源于蝙蝠。
2月7日，华南农业大学官方网站发布消息称，华南农业大学、岭南现代农业科学与技术广东省实验室沈永义教授、肖立华教授等科研人员联合开展的最新研究表明，穿山甲为新型冠状病毒潜在中间宿主。此后，2月18日，香港大学管轶团队与广西医科大学胡艳玲课题组再次发表论文证明穿山甲很可能是新冠病毒从蝙蝠到人类的中间宿主。
此次湖北医药学院附属人民医院的刘龙联合广州暨南大学吴建国课题组的研究，则是新冠病毒溯源工作的又一项突破。
相比穿山甲，龟类在市场更为普遍
该项研究指出，新冠病毒编码至少27种蛋白质，包括15种非结构蛋白、4种结构蛋白和8种辅助蛋白。刺突蛋白（S）是一种结构蛋白，位于病毒体的外壳上，负责与宿主受体血管紧张素转换酶2（ACE2）结合。研究刺突蛋白中受体结合区域（RBD）序列的进化关系有助于理解病毒起源趋势。
研究结果显示，蝙蝠SARS样病毒 RaTG13与新冠病毒整体基因组具有96.2%的序列同一性。需要注意的是，SARS病毒是穿山甲标本中分布最广的冠状病毒。
研究组通过比对来自SARS病毒、蝙蝠或穿山甲SARS样病毒和新冠病毒的刺突蛋白的RBD序列，分析发现新冠病毒RBD序列来自329-521部分与穿山甲SARS样病毒 SRR10168377有93%的相似度，这要高于其与蝙蝠SARS样病毒 RaTG13 89%的相似性。
而穿山甲SARS样病毒 SRR10168377与蝙蝠SARS样病毒 RaTG13只有85%的同一性，如果只关注刺突RBD，穿山甲SARS样病毒 SRR10168377更有可能越过物种屏障感染人类。
从具有ACE2受体41和353位的RBD域中的Asn501来看，龟类和穿山甲似乎比蝙蝠更接近人类。这表明龟类和穿山甲可能是新冠病毒的潜在中间宿主。
病毒受体结合序列和宿主受体的分析有助于快速锁定新冠病毒可能的中间宿主。而与非法交易的穿山甲相比，市场上的龟类更普遍受欢迎。
中间宿主更多，溯源更为艰难
文章在最后讨论部分指出，了解结构结合机制将有助于找到准确的病毒库，并有助于制定预防对策。据报道，新冠病毒刺突蛋白与宿主受体血管紧张素转换酶2（ACE2）的结合能力比SARS病毒强得多。这表明新冠病毒的中间宿主更多，短期内找到新冠病毒的中间宿主也很难。
目前已知龟类携带数十种病毒，包括虹蛙病毒（RV）、尼多病毒（NV）、乳头瘤病毒（PV）、甲鱼虹彩病毒（STIV）、甲鱼系统性败血症球状病毒（STSSSV）、龟细小核糖核酸病毒（ToPV）和中华鳖出血综合征病毒（TSHSV），不能排除蝙蝠SARS样CoV RaTG13或其他SARS样病毒感染龟类，并在其进化后向人传播。
从SARS病毒、MERS病毒到新冠病毒，皆指向蝙蝠是冠状病毒的天然宿主，但中间宿主却各不相同。此前研究表明，与其他动物相比，蛇因其同义密码子相对使用度（RSCU）偏向，很有可能是新冠病毒的野生动物病毒库。
该项研究提供的信息表明，与蛇和穿山甲一样，龟类（西部锦龟、绿海龟、中华鳖）也可能是将新冠病毒传播给人类的潜在中间宿主，但仍需进一步研究来确认。
总之，不管是之前非典事件中的果子狸，还是新冠肺炎中的蛇、穿山甲、龟类，食用野味都是一大陋习。在近日出台的全国人大常委会《决定》，已确立了全面禁止食用野生动物的制度，明确规定对涉及对野生动物违法犯罪行为要加重处罚，并对全面禁止以食用为目的的猎捕、交易、运输陆生野生动物做出明确规定。
按照全国人大常委会最新公布的决定，凡是没有列入畜禽遗传资源目录的陆生野生动物，一律禁止食用，不管是不是属于重点保护的野生动物。但相关具体的名录，还在进一步的完善和健全中。
参考资料：
[1]Liu Z， Xiao X， Wei X， et.al， Composition and divergence of coronavirus spike proteins and host ACE2 receptors predict potential intermediate hosts of SARS‐CoV‐2. J Med Virol. Accepted Author Manuscript
[2]国家卫健委，截至2月27日24时新型冠状病毒肺炎疫情最新情况，2020-02-28
[3]中国政府网，国务院联防联控机制权威发布，2020-02-27
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