Gut:ZNF365亚型D的变异型与克罗恩病相关

2011-07-29 MedSci原创 MedSci原创

      最近,美国学者Talin Haritunians等,进行了一项全基因组关联研究,确定了多个克罗恩病(CD)易感基因位点,包括与10q21的非编码基因间单核苷酸多态性(SNP)相关。结果表明,非同义的Ala62Thr SNP,rs7076156构成了10q21与CD风险相关的基础的假说,并说明这种SNP在ZNF365亚型D的控制下,通过改

      最近,美国学者Talin Haritunians等,进行了一项全基因组关联研究,确定了多个克罗恩病(CD)易感基因位点,包括与10q21的非编码基因间单核苷酸多态性(SNP)相关。结果表明,非同义的Ala62Thr SNP,rs7076156构成了10q21与CD风险相关的基础的假说,并说明这种SNP在ZNF365亚型D的控制下,通过改变这些基因的表达来发挥作用。该项研究发表在《胃肠道》(Gut)上。

    为了精确描绘10q21位点,研究者们对1632例CD和961例对照中的86个SNP进行了基因型描述,并使用罗杰斯(logistic)回归进行单一标记和条件分析。

    与CD危险性相关的基因横跨了11个SNP(p<0.001)。观察到的最显著的相关性,为位于非同义的SNP,rs7076156(Ala62Thr)。丙氨酸等位基因在CD中表现过多(p=5.23×10−7;OR=1.39(95% CI 1.22 到1.58));等位基因频率在CD中为76%,在对照中为69.7%。对rs7076156的条件分析使其他的显著相关均作废,说明它是这一位置的致病变异型。ZNF365的四种亚型已被确认,rs7076156位于ZNF365亚型D的一个特异性外显子上。作者使用逆转录PCR证实,ZNF365D在切除肠道中的表达,同时来源于CD受试者和对照。在来源于CD受试者的风险等位基因(Ala)的纯合子的EB病毒转化的淋巴样干细胞系中,发现ZNF365D平均表达水平显著降低。一个全基因组芯片表达研究进一步表明,ZNF365亚型D的Ala62Thr改变与CD 中ARL4A, MKKS, RRAGD, SUMF2, TDR1 ZNF148基因的差异表达相关。

    相关内容:Variants in ZNF365 isoform D are associated with Crohn's disease

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