Sci Rep:根据TCGA甲基化数据确定非小细胞肺癌的预后标记

2020-05-23 xiangting MedSci原创

这项研究建立了一种新型的甲基化标记,可以可靠地预测NSCLC患者的预后。

非小细胞肺癌(NSCLC)是一种常见的恶性肿瘤,其预后很差。准确的预测预后可以更好地指导患者的风险分层和治疗决策,并可以优化结局。这项研究利用癌症基因组图谱(TCGA)中的临床和甲基化/表达数据,对早期NSCLC进行了全面评估,以确定可以预测生存率的甲基化标记。

纳入349例接受根治性手术的NSCLC患者,并将其进一步分为训练队列和验证队列。在训练队列中,根据单因素和多因素回归分析确定了4000个甲基化位点对预后有影响。进行KEGG通路分析以确定关键通路。进行层次聚类和WGCNA共表达分析对样本表型和分子亚型进行分类。

通过网络分析确定了中心 5'-C-磷酸-G-3'(CpG)位点,然后进一步用于构建预后标记。在验证队列中进一步验证了预后模型的预测能力。在聚类分析的基础上,确定了6种临床分子亚型,它们与不同的临床特征和总体生存率相关。第4组和第6组的结局最佳和最差。研究确定了17个中心CpG位点,并使用它们的加权组合建立了预后模型(风险评分)。风险评分与手术后的结局显著相关;在训练和验证队列中,风险评分高的患者总生存率低(P<0.01)。

这项研究建立了一种新型的甲基化标记,可以可靠地预测NSCLC患者的预后。

原始出处:

Yifan Wang. Identification of prognostic signature of non–small cell lung cancer based on TCGA methylation data. Sci Rep. 22 May 2020.

本文系梅斯医学(MedSci)原创编译整理,转载需授权!

相关资讯

FDA批准武田的酪氨酸激酶抑制剂ALUNBRIG(brigatinib),一线治疗ALK阳性的转移性非小细胞肺癌患者

结果表明ALUNBRIG优于克唑替尼,具有显着的抗肿瘤活性,尤其是在脑转移患者中。

靶向HER2的抗体药物偶联物ENHERTU获得FDA授予突破性疗法称号,治疗HER2阳性转移性非小细胞肺癌

Enhertu已经获得了FDA授予针对HER2阳性乳腺癌、胃癌和非小细胞肺癌的突破性疗法称号。

美国批准PD-L1单抗Tecentriq,用于非小细胞肺癌的一线治疗

在美国,PD-L1单抗Tecentriq(atezolizumab)已获得NSCLC的四项批准。

ASCO 2020:罗氏的TIGIT单抗tiragolumab与PD-L1单抗Tecentriq联合,延长了非小细胞肺癌患者生存期

TIGIT靶向抗体tiragolumab与Tecentriq组合能够提高NSCLC患者的客观缓解率和无进展生存期。

FDA批准百时美施贵宝的PD-1单抗Opdivo和CTLA-4单抗Yervoy组合,一线治疗非小细胞肺癌

百事美施贵宝(Bristol Myers Squibb)公司宣布,FDA已批准其PD-1单抗Opdivo(nivolumab)和CTLA-4单抗Yervoy(ipilimumab)联合,用于治疗PD-

Lancet Oncol :Atezolizumab联合卡波铂和nab-paclitaxel用于非小细胞肺癌术前化疗

Atezolizumab联合卡波铂和nab-paclitaxel治疗可作为可切除非小细胞肺癌术前化疗的新辅助治疗方案,有很高比例的患者获得了病理反应