BMC Med:拥有中东血统的2型糖尿病人群中存在保护肾功能的基因

背景：慢性肾脏疾病(CKD)是一个主要的公共卫生问题，影响着超过13%的世界人口。与衰老、肥胖和高血压一样，2型糖尿病(T2D)是慢性肾脏病的主要原因之一，糖尿病患者中有1：10死于肾功能衰竭。慢性肾脏病是由肾功能逐渐丧失引起的，其特征是肾小球滤过率(GFR)和/或其他肾脏损害的标志。UMOD、GPX1、GSTO1、GSTO2、SHROOM3和MGP等基因的变异与CKD的易感性有关。慢性肾脏病的患病率因种族而异，其中非裔美国人的风险尤其高。

     马尔莫市是一个多元文化的城市，聚集有大约180个国家人民。三分之一的公民出生在国外，其中最大的移民群体出生在伊拉克，占总人口的3.4%。MEDIM研究的数据显示，马尔默的伊拉克移民患T2D的风险是瑞典人的两倍，与瑞典出生的人口相比，他们发病年龄更小，糖尿病家族史负担较高，血糖控制和胰岛素敏感性较差。矛盾的是，尽管伊拉克移民的代谢健康状况较差，但他们的肾脏功能比瑞典移民更好，血压更低，这使得这一群体成为这些特征基因研究的有趣队列。在这里，我们评估了居住在瑞典南部的伊拉克血统的人估计的肾小球滤过率(EGFR)和其他代谢特征的遗传基础。

方法：使用线性混合模型对1201名伊拉克出生的马尔莫市居民进行了EGFR和其他10个代谢性状的全基因组关联研究(GWAS)分析，以说明家庭结构。

结果：在Cst9(rs13037490；P值=2.4×10−13)中检测到最强的关联信号，这是一个先前与基于cystatin C的表皮生长因子受体相关的基因群；重要的是，这里的效应(主)等位基因与其他群体的效应(次要)等位基因相反，表明该基因群存在有利的选择。此外，还发现了EGFR(ERBB4)、空腹血糖(CAMTA1、NDUFA10、TRIO、WWC1、TRAPPC9、SH3GL2、ABCC11)、定量胰岛素敏感性检查指数(METTL16)和HbA1C(CAMTA1、ME1、PAK1、RORA)等新的全基因组显著基因群。

图1曼哈顿地区的SNPs与A空腹血糖、B HbA1C、C EGFR和D Quicki之间的关系。曲线图显示−log10P值(y轴)与染色体位置(x轴)。红线表示全基因组显著阈值(P值=5×10⁻⁸)

图2 20号染色体上与EGFR相关的rs13037490的区域图。-log10转换后的P值与基因组位置对应。用黑色圈出的深紫色代表rs13037490；灰色代表显著水平以下的SNP；红色圆圈代表显著的SNP；从红色到蓝色的不同深浅的圆圈表示与顶部领先的SNP成对r2值的范围(Rs13037490)。区域图B放大A。已定位的基因、未定位的蛋白质编码基因和未定位的非编码基因分别用红色、蓝色和深灰色表示

表1与FG、HbA1C、QuickI和EGFR相关的领先SNP(具有全基因组显著信号)

结论：这里发现的遗传效应可能有助于解释为什么中东人的肾功能比欧洲人的更好，中东移民2型糖尿病患者生存优势的基础便是这肾功能保留的遗传易感性。

原文出处： Mohamed SA,  Fernadez-Tajes J,et al.GWAS in people of Middle Eastern descent reveals a locus protective of kidney function-a cross-sectional study.BMC Med 2022 Mar 01;20(1)