Circulation：单细胞测序发现细胞骨架相关蛋白4是成纤维细胞激活的新型调节因子
2018-07-11 MedSci MedSci原创
全基因组转录本分析大大提高了我们对基础心脏生理和驱动疾病的机制的调控网络的了解。但迄今为止，研究成人心脏的基因表达谱的分辨率局限于从整个组织中提取RNA。采用组织同源物就会丧失细胞起源或细胞特异性基因表达变化的相关信息。近期，RNA扩增技术的发展为进行单细胞转录本分析提供可能。Monika M. Gladka等人提出一种从成年小鼠的心脏组织中获取高质量的RNA的方法，可用于对健康和患病心脏进行单细
全基因组转录本分析大大提高了我们对基础心脏生理和驱动疾病的机制的调控网络的了解。但迄今为止，研究成人心脏的基因表达谱的分辨率局限于从整个组织中提取RNA。
采用组织同源物就会丧失细胞起源或细胞特异性基因表达变化的相关信息。近期，RNA扩增技术的发展为进行单细胞转录本分析提供可能。
Monika M. Gladka等人提出一种从成年小鼠的心脏组织中获取高质量的RNA的方法，可用于对健康和患病心脏进行单细胞测序。
经过优化，研究人员可在体内平衡条件下和缺血性损伤后对成年心脏组织进行单细胞测序。基于差异性表达基因的荟聚分析可显示所有的主要的心脏细胞类型的已知的和新型标志物。基于差异性表达基因，研究人员在特定的细胞类型中发现多个亚群。除此之外，对健康和受伤心脏进行单细胞测序对比发现了存在于特定疾病的细胞亚群。诸如此类，研究人员发现细胞骨架相关蛋白4是激活的成纤维细胞的新型标志物，与小鼠和人类心肌组织中已知的成纤维细胞标志物呈正相关。与对照相比，用转化生长因子β抑制活化的成纤维细胞的细胞骨架相关蛋白4可增强与活化的成纤维细胞相关的基因表达，提示骨架相关蛋白4具有调节受损心脏的成纤维细胞活化的作用。
我们科通过对健康和患病成年心脏进行单细胞测序来研究患心脏病时心脏细胞之间的转录差异以及细胞特异性的基因表达变化。这种新方法为研究心脏生理病理相关的细胞过程的分子变化提供大量新的发现。应用该方法或许可帮助我们找到新的心脏病的治疗靶点。
原始出处：
Monika M. Gladka， et al. Single-Cell Sequencing of the Healthy and Diseased Heart Reveals Cytoskeleton-Associated Protein 4 as a New Modulator of Fibroblasts Activation. Circulation. July 10，2018.https：//doi.org/10.1161/CIRCULATIONAHA.117.030742
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