Int J Biol Sci:单细胞解析喉鳞状细胞癌肿瘤生态系统的进展轨迹
2026-05-14 熊佳仪 MedSci原创 发表于上海
本研究首次系统揭示了从正常组织到癌前病变再到浸润癌过程中喉鳞癌肿瘤微环境的动态重塑特征。
深度解析医学证据,DeepEvidence为你支撑决策 喉鳞状细胞癌是头颈部第二常见的恶性肿瘤,约60%的患者确诊时已处于晚期,传统治疗效果有限且副作用严重。声带白斑是喉鳞癌最常见的癌前病变,但其恶性转化的分子机制尚不明确。本研究通过整合喉鳞癌、声带白斑及癌前病变的单细胞和 bulk RNA-seq 数据,系统描绘了喉鳞癌发生发展过程中肿瘤微环境的动态重塑。研究团队从公共数据库获取了包含10例喉鳞癌前病变、10例声带息肉、10例声带白斑和10例配对喉鳞癌样本的单细胞数据,并整合TCGA和GEO中的多个喉鳞癌 bulk 转录组数据集。经过严格的质量控制和批次效应校正,共保留302,558个单细胞用于后续分析。通过拷贝数变异分析鉴定恶性上皮细胞,利用高维加权基因共表达网络分析揭示恶性上皮细胞的转录调控模块,采用CellChat和NicheNet进行细胞间通讯分析,并结合体外细胞功能实验及体内异种移植瘤模型进行验证。 方法部分详细描述了单细胞数据的处理流程:使用Seurat包进行降维聚类,Harmony算法去除批次效应,DoubletFinder剔除双细胞。通过InferCNV区分恶性与非恶
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