Circulation:单细胞RNA测序揭示器官特异性内皮细胞的不同特征

2020-11-11 星云 MedSci原创

内皮细胞(EC)根据其所在的血管和组织表现出较大的功能异质性。虽然这些功能差异可能被印在了转录组中,但维持EC异质性的通路和网络尚未完全明确。

内皮细胞(EC)根据其所在的血管和组织表现出较大的功能异质性。虽然这些功能差异可能被印在了转录组中,但维持EC异质性的通路和网络尚未完全明确。

为了研究EC特异性的转录组基础,Paik等分析了来自Tabra Muris集团的小鼠组织特异性EC的单细胞RNA测序数据。

12种器官内皮细胞的单细胞转录组

经分析发现,通过单细胞RNA测序和组织块RNA测序产生的组织特异性EC转录组数据之间有很强的相关性,验证了该方法的可靠性。采用基于GRAPH的聚类算法,研究人员发现某些组织特定的EC明显根据器官而聚类(如,肝、脑),而其他组织来源的EC的转录组有明显的重叠(如,脂肪、心)。

Lars2在雄性EC中特异性表达

此外,研究人员还明确了可能与维持其特征的组织特异性EC和信号通路的新型标记。性别是内皮细胞转录组中异质性的重要来源,研究人员发现Lars2基因在雄性小鼠EC中高度富集。小鼠心脏和肺EC的标志物在人类胎儿心脏和肺EC中保守。通过分析配体和受体表达模式,研究人员还确定了组织特异性EC和其他细胞类型之间潜在的血管分泌相互作用。

总之,Paik等人通过对单细胞RNA测序数据进行分析揭示了维持组织特异性EC特征的转录网络,并发现了组织特异性EC之间的血管分泌和功能性相互作用。

原始出处:

David T. Paik, et al. Single-Cell RNA Sequencing Unveils Unique Transcriptomic Signatures of Organ-Specific Endothelial Cells. Circulation. 2020;142:1848–1862

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  1. 2020-11-11 青忧禾支

    学习了

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  2. 2020-11-11 jyzxjiangqin

    好文章!

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  3. 2020-11-11 Psycho.Dr Du

    新技术的发展对促进医学进步真的是事半功倍呀!#医学技术#

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  4. 2020-11-11 咻凡

    内皮细胞(EC)根据其所在的血管和组织表现出较大的功能异质性。虽然这些功能差异可能被印在了转录组中,但维持EC异质性的通路和网络尚未完全明确。

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