Diabetologia:1型糖尿病遗传易感性儿童的血液转录组学中肠道病毒相关的变化

2018-04-24 MedSci MedSci原创

近日,国际杂志 《Diabetologia》上在线发表一项关于1型糖尿病遗传易感性儿童的血液转录组学中肠道病毒相关的变化的研究。 多项研究表明肠道病毒感染与1型糖尿病的发展有关,但对有发生1型糖尿病风险的儿童肠道病毒诱导的反应知之甚少。研究人员的目标是使用全基因转录组学数据来描述患有1型糖尿病遗传易感性的儿童的全血样品中肠道病毒相关的变化的特征。 研究人员从28对患1型糖尿病的风险增加

近日,国际杂志 《Diabetologia》上在线发表一项关于1型糖尿病遗传易感性儿童的血液转录组学中肠道病毒相关的变化的研究。 多项研究表明肠道病毒感染与1型糖尿病的发展有关,但对有发生1型糖尿病风险的儿童肠道病毒诱导的反应知之甚少。研究人员的目标是使用全基因转录组学数据来描述患有1型糖尿病遗传易感性的儿童的全血样品中肠道病毒相关的变化的特征。 研究人员从28对患1型糖尿病的风险增加的儿童收集的纵向全血样品(总共356个样品)并筛查肠道病毒RNA。其中7个样本经检测为肠道病毒阳性,从不同的儿童收集样本,并分析这些儿童的转录组学数据以了解与肠道病毒感染有关的个体水平反应。将肠道病毒阳性时具有峰值或降低表达的转录物作为肠道病毒相关信号。 研究发现,在肠道病毒阳性的四名儿童中检测到干扰素应答激活,而另外三名儿童的转录组改变表明适应性免疫应答的激活。另外,大部分肠道病毒相关的变化都是特定于某个个体的。使用在四个儿童中肠病毒阳性的339个基因建立了肠病毒诱导的标记,并且这些基因中的77个在不同肠道病毒感染的人外周血单核细胞中也上调。这些基因可精确地将从四种肠道病毒阳性样品从剩余的352份血液样

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