Sci Rep：尿液外泌体和游离DNA检测膀胱尿路上皮癌的体细胞变异和拷贝数变异
2018-10-13 AlexYang MedSci原创
尿路上皮膀胱癌（UBC）可以通过很多的遗传变异来鉴定。来自尿液的DNA检测是一种非常有前景的用来进行泌尿系肿瘤液体活检的方法。最近，有研究人员评估了尿液中游离DNA（cfDNA）和外泌体DNA（exoDNA）作为UBC液体活检的一种来源的有效性。研究包括了9名患者，这些患者因UBC经历了外科手术，并且对他们的肿瘤样本、匹配的尿液cfDNA和exoDNA进行了基因组分析。研究发现，在6名患者中发现了
尿路上皮膀胱癌（UBC）可以通过很多的遗传变异来鉴定。来自尿液的DNA检测是一种非常有前景的用来进行泌尿系肿瘤液体活检的方法。最近，有研究人员评估了尿液中游离DNA（cfDNA）和外泌体DNA（exoDNA）作为UBC液体活检的一种来源的有效性。
研究包括了9名患者，这些患者因UBC经历了外科手术，并且对他们的肿瘤样本、匹配的尿液cfDNA和exoDNA进行了基因组分析。研究发现，在6名患者中发现了17个体细胞变异。在17个体细胞变异中，通过cfDNA和exoDNA检测到的数目分别为14个和12个，AFs分别为56.2%和65.6%。在利用sWGS进行的CNV分析中，尽管平均测序深度只有0.6X，研究人员发现了 MDM2， ERBB2， CCND1和CCNE1表达量的变大和CDKN2A， PTEN以及RB1的缺失，这些在UBC中均为已知的高变异位点。cfDNA和exoDNA的CNV分析表明了与肿瘤样本相似的情况。肿瘤与cfDNA的皮尔森相关系数为0.481，肿瘤与exoDNA的相关系数为0.412，均比肿瘤与正常样本的的相关系数（0.086）更高。
最后，研究人员指出，他们成功的利用尿液cfDNA和exoDNA对UBC中的CNV进行了鉴定。同时，利用sWGS进行CNV分析是一种可选择的策略来进行液体活检，从而在提供全基因组数据的情况下降低成本。
原始出处：
Dong Hyeon Lee， Hana Yoon， Sanghui Park et al. Urinary Exosomal and cell-free DNA Detects Somatic Mutation and Copy Number Alteration in Urothelial Carcinoma of Bladder. Sci Rep. 02 Oct 2018.
本文系梅斯医学（MedSci）原创编译整理，转载需授权！
小提示：本篇资讯需要登录阅读，点击跳转登录
版权声明：
本网站所有内容来源注明为“梅斯医学”或“MedSci原创”的文字、图片和音视频资料，版权均属于梅斯医学所有。非经授权，任何媒体、网站或个人不得转载，授权转载时须注明来源为“梅斯医学”。其它来源的文章系转载文章，或“梅斯号”自媒体发布的文章，仅系出于传递更多信息之目的，本站仅负责审核内容合规，其内容不代表本站立场，本站不负责内容的准确性和版权。如果存在侵权、或不希望被转载的媒体或个人可与我们联系，我们将立即进行删除处理。
在此留言
本网站所有内容来源注明为“梅斯医学”或“MedSci原创”的文字、图片和音视频资料，版权均属于梅斯医学所有。非经授权，任何媒体、网站或个人不得转载，授权转载时须注明来源为“梅斯医学”。其它来源的文章系转载文章，或“梅斯号”自媒体发布的文章，仅系出于传递更多信息之目的，本站仅负责审核内容合规，其内容不代表本站立场，本站不负责内容的准确性和版权。如果存在侵权、或不希望被转载的媒体或个人可与我们联系，我们将立即进行删除处理。
在此留言
#拷贝数变异#
36
#DNA检测#
38
#拷贝数#
30
#膀胱尿路上皮癌#
0
#变异#
34
#体细胞#
28
#尿液#
22
#上皮癌#
24
#游离DNA#
33
了解一下，谢谢分享！
64